119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1130 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 484 aa  980    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  51.11 
 
 		 488 aa  473  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  51.53 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  32.7 
 
 		 582 aa  226  6e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.52 
 
 		 492 aa  156  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  29.87 
 
 		 548 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.86 
 
 		 741 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  26.1 
 
 		 780 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  27.36 
 
 		 750 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.5 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  23.66 
 
 		 763 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  24.23 
 
 		 750 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  23.25 
 
 		 799 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  23.14 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  25.75 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  28.79 
 
 		 779 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  24.16 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  27.2 
 
 		 729 aa  61.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 916 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  24.94 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 781 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  23.5 
 
 		 783 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  23.55 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 928 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  30.83 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  23.14 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  24.89 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  24.89 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 916 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.37 
 
 		 744 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.73 
 
 		 775 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  31.48 
 
 		 736 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.64 
 
 		 733 aa  56.6  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  22.99 
 
 		 917 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  24.29 
 
 		 899 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  21.77 
 
 		 651 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  23.92 
 
 		 795 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  31.78 
 
 		 707 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  28.49 
 
 		 899 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  23.72 
 
 		 721 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  32.63 
 
 		 726 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 		 1027 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  35.14 
 
 		 804 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.77 
 
 		 885 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.3 
 
 		 724 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  23.13 
 
 		 948 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  23.08 
 
 		 823 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  29.03 
 
 		 701 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  28.21 
 
 		 783 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  31.58 
 
 		 741 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  34.38 
 
 		 747 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  22.74 
 
 		 921 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  26.67 
 
 		 807 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 912 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  24.65 
 
 		 873 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  29.37 
 
 		 922 aa  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.48 
 
 		 711 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  28.28 
 
 		 801 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.9 
 
 		 905 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  27.72 
 
 		 892 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  20.88 
 
 		 859 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  26.82 
 
 		 1495 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  23.34 
 
 		 850 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  21.05 
 
 		 885 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  29.46 
 
 		 726 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  23.95 
 
 		 811 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  29.91 
 
 		 777 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  22.94 
 
 		 829 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.76 
 
 		 928 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  30.61 
 
 		 784 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  29.6 
 
 		 836 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.47 
 
 		 927 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  23.75 
 
 		 800 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.25 
 
 		 962 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.16 
 
 		 1502 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  20.97 
 
 		 765 aa  47  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  30.63 
 
 		 725 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  24.19 
 
 		 898 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 937 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  27.08 
 
 		 906 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  28.06 
 
 		 887 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  22.55 
 
 		 883 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  47.73 
 
 		 843 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  26.83 
 
 		 904 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 		 745 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  23.46 
 
 		 834 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  24.2 
 
 		 731 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  38.89 
 
 		 778 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.72 
 
 		 912 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  23.64 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  28.06 
 
 		 887 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.31 
 
 		 1412 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  26.37 
 
 		 760 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.9 
 
 		 880 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.73 
 
 		 820 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  22.1 
 
 		 792 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  20.35 
 
 		 899 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 		 792 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>