More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1058 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.82 
 
 
915 aa  1392    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.58 
 
 
926 aa  667    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.63 
 
 
912 aa  1332    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.48 
 
 
916 aa  1387    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
916 aa  1820    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 
932 aa  600  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  37.28 
 
 
955 aa  568  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.64 
 
 
944 aa  560  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  37.72 
 
 
939 aa  548  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.81 
 
 
909 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 
928 aa  538  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  36.68 
 
 
898 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.01 
 
 
927 aa  534  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  36.08 
 
 
943 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.56 
 
 
897 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.67 
 
 
903 aa  525  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  37.28 
 
 
903 aa  525  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.79 
 
 
937 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  36.15 
 
 
946 aa  514  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.69 
 
 
890 aa  511  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.66 
 
 
946 aa  511  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
928 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.15 
 
 
972 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.1 
 
 
970 aa  496  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  34.72 
 
 
954 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
905 aa  481  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.59 
 
 
913 aa  478  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.76 
 
 
913 aa  451  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  34.18 
 
 
888 aa  325  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  35.49 
 
 
870 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  35.41 
 
 
872 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  31.24 
 
 
874 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.25 
 
 
1688 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  31.29 
 
 
874 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  35.27 
 
 
875 aa  306  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  31.24 
 
 
874 aa  304  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.39 
 
 
873 aa  303  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.94 
 
 
1476 aa  294  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.39 
 
 
872 aa  294  5e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  36.72 
 
 
1480 aa  289  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.36 
 
 
1502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  35.75 
 
 
1535 aa  281  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  34.34 
 
 
1495 aa  280  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  35.49 
 
 
1584 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  34.36 
 
 
1523 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.36 
 
 
1523 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.56 
 
 
1538 aa  276  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.92 
 
 
915 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.31 
 
 
1538 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  34.42 
 
 
1534 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.3 
 
 
1523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  33.74 
 
 
1632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.65 
 
 
1538 aa  275  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  31.69 
 
 
1538 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  31.69 
 
 
1538 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.69 
 
 
1538 aa  274  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.65 
 
 
1514 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  31.56 
 
 
1538 aa  272  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  32.97 
 
 
922 aa  272  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 
900 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.15 
 
 
933 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.72 
 
 
1534 aa  272  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.06 
 
 
931 aa  271  4e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.71 
 
 
1493 aa  271  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.89 
 
 
1497 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  33.71 
 
 
1567 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.38 
 
 
1525 aa  268  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  33.33 
 
 
914 aa  267  8e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  34.29 
 
 
1620 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.03 
 
 
1412 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 
1516 aa  266  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  34.29 
 
 
941 aa  265  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  34.62 
 
 
1572 aa  265  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  33.83 
 
 
1649 aa  265  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.64 
 
 
824 aa  263  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 
1517 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  34.14 
 
 
1544 aa  261  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  31.62 
 
 
1431 aa  260  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  35.36 
 
 
1536 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  33.28 
 
 
1644 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
1508 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.7 
 
 
1553 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.37 
 
 
1510 aa  258  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.99 
 
 
1505 aa  258  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  31.32 
 
 
1573 aa  257  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.15 
 
 
1480 aa  257  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  35.16 
 
 
1515 aa  257  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.2 
 
 
1518 aa  257  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  31.06 
 
 
1509 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  34.25 
 
 
1504 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.19 
 
 
1539 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  34.87 
 
 
1536 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  34.71 
 
 
1536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.98 
 
 
1561 aa  254  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  33.49 
 
 
1549 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.07 
 
 
1475 aa  253  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.24 
 
 
1448 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  36.75 
 
 
1448 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  32.84 
 
 
1506 aa  253  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  28.67 
 
 
1435 aa  251  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>