More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1565 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.9 
 
 
937 aa  1533    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
928 aa  1864    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.96 
 
 
944 aa  642    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.36 
 
 
927 aa  1562    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.66 
 
 
970 aa  870    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.41 
 
 
928 aa  1547    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  40.55 
 
 
939 aa  634  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  40.77 
 
 
943 aa  635  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.45 
 
 
932 aa  619  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  39.54 
 
 
946 aa  612  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  38.98 
 
 
955 aa  612  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  39.83 
 
 
954 aa  599  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.14 
 
 
972 aa  590  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.01 
 
 
890 aa  539  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  35.98 
 
 
898 aa  539  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.02 
 
 
916 aa  537  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.68 
 
 
915 aa  526  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 
903 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  35.9 
 
 
903 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.8 
 
 
926 aa  516  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.92 
 
 
912 aa  513  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.64 
 
 
909 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
916 aa  512  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.57 
 
 
897 aa  498  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.94 
 
 
905 aa  464  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.53 
 
 
913 aa  450  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 
913 aa  436  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.13 
 
 
946 aa  426  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  34.96 
 
 
888 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.77 
 
 
875 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  34.07 
 
 
1688 aa  385  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  34.61 
 
 
873 aa  382  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.04 
 
 
870 aa  350  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31.31 
 
 
872 aa  347  6e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.39 
 
 
933 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.19 
 
 
1435 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  31.08 
 
 
1480 aa  323  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 
931 aa  322  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.97 
 
 
1476 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.94 
 
 
1434 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.55 
 
 
1412 aa  320  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  32.15 
 
 
1388 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.82 
 
 
1426 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 
1523 aa  318  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
900 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  30.69 
 
 
874 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  30.43 
 
 
874 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.7 
 
 
1429 aa  314  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.72 
 
 
1451 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.48 
 
 
1523 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.48 
 
 
1523 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  31.52 
 
 
1504 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  30.8 
 
 
874 aa  310  9e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  31.05 
 
 
922 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 
1514 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  30.34 
 
 
1431 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  30.55 
 
 
1584 aa  308  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  34.83 
 
 
1448 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 
1475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
1497 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  30.8 
 
 
915 aa  304  6.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 
1517 aa  304  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  30.76 
 
 
1544 aa  301  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  32.35 
 
 
1419 aa  301  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  34.4 
 
 
1448 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.9 
 
 
1510 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
1534 aa  300  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  29.85 
 
 
1573 aa  299  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.76 
 
 
1495 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.58 
 
 
1535 aa  296  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  30.88 
 
 
1506 aa  295  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  30.04 
 
 
914 aa  295  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.22 
 
 
1539 aa  294  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.48 
 
 
872 aa  293  7e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
1480 aa  293  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  29.71 
 
 
1567 aa  292  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  30.52 
 
 
1523 aa  292  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  31.4 
 
 
1509 aa  291  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  30.34 
 
 
1513 aa  291  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.72 
 
 
1561 aa  290  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 
1516 aa  290  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  32.6 
 
 
1606 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  31.05 
 
 
1493 aa  285  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  29.82 
 
 
1536 aa  284  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.35 
 
 
1508 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.12 
 
 
1553 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  29.59 
 
 
1536 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  35.47 
 
 
1515 aa  282  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.59 
 
 
1626 aa  282  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  29.78 
 
 
1531 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.14 
 
 
1518 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  29.59 
 
 
1536 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.63 
 
 
1505 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  37.13 
 
 
1598 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.59 
 
 
1538 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.7 
 
 
1538 aa  278  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  37.05 
 
 
1599 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  28.7 
 
 
1538 aa  277  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.79 
 
 
1700 aa  277  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.7 
 
 
1538 aa  277  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>