148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1268 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  100 
 
 		 488 aa  991    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  51.11 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  47.32 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  34.37 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.83 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  27.95 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  28.73 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.45 
 
 		 763 aa  86.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  28.69 
 
 		 799 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.73 
 
 		 733 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  25.07 
 
 		 741 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 		 729 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  28.18 
 
 		 780 aa  73.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.11 
 
 		 737 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  24.04 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  25.7 
 
 		 836 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  26.51 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  22.71 
 
 		 914 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.21 
 
 		 726 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.42 
 
 		 675 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.44 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  28.75 
 
 		 1027 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  33.62 
 
 		 750 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.22 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.24 
 
 		 736 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  28.98 
 
 		 779 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.02 
 
 		 744 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 781 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  22.96 
 
 		 859 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.97 
 
 		 898 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  27.97 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  26.67 
 
 		 834 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  22.71 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.13 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.43 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  26.24 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 795 aa  57  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  23.58 
 
 		 722 aa  57  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  21.68 
 
 		 728 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  22.69 
 
 		 778 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  24.29 
 
 		 901 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  23.98 
 
 		 850 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  29.73 
 
 		 750 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.32 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  25.26 
 
 		 791 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.97 
 
 		 801 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 916 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  19.65 
 
 		 885 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  26.38 
 
 		 694 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.86 
 
 		 698 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  24.16 
 
 		 933 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.96 
 
 		 694 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.93 
 
 		 909 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  26.34 
 
 		 726 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  27.56 
 
 		 825 aa  53.5  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  24.44 
 
 		 753 aa  53.5  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  23.82 
 
 		 917 aa  53.5  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  24.51 
 
 		 880 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  27.21 
 
 		 948 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.75 
 
 		 932 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 		 829 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 792 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  22.83 
 
 		 783 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  22.68 
 
 		 883 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 916 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  27.88 
 
 		 823 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  22.05 
 
 		 887 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  22.22 
 
 		 805 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  26.11 
 
 		 922 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  22.89 
 
 		 800 aa  52  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  34.45 
 
 		 828 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.96 
 
 		 926 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.25 
 
 		 885 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  29.51 
 
 		 804 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  21.65 
 
 		 887 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  28.45 
 
 		 807 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.31 
 
 		 711 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.46 
 
 		 706 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  31.93 
 
 		 777 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.53 
 
 		 821 aa  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  22.78 
 
 		 722 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25 
 
 		 837 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  24.18 
 
 		 661 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.75 
 
 		 946 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 		 731 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  21.7 
 
 		 908 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  25.79 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.74 
 
 		 734 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.23 
 
 		 824 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  27.69 
 
 		 904 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.88 
 
 		 903 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  32.11 
 
 		 1209 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  27.46 
 
 		 899 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  26.92 
 
 		 888 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.68 
 
 		 912 aa  48.5  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  25.2 
 
 		 903 aa  47.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.96 
 
 		 820 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  27.18 
 
 		 860 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  31.47 
 
 		 801 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>