More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1014 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 946 aa  1889    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.66 
 
 		 916 aa  521  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.62 
 
 		 916 aa  514  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.03 
 
 		 912 aa  511  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 		 926 aa  501  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  34.79 
 
 		 955 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 		 932 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.99 
 
 		 915 aa  492  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  34.28 
 
 		 939 aa  488  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  34.85 
 
 		 943 aa  487  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.57 
 
 		 903 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  33.65 
 
 		 898 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 		 909 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 		 905 aa  467  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.59 
 
 		 897 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  34.9 
 
 		 946 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  34.53 
 
 		 954 aa  466  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.17 
 
 		 944 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.37 
 
 		 913 aa  458  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.13 
 
 		 972 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 928 aa  445  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.28 
 
 		 913 aa  437  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.13 
 
 		 928 aa  433  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.77 
 
 		 890 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 		 927 aa  428  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  31.69 
 
 		 903 aa  429  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.81 
 
 		 937 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 		 970 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.29 
 
 		 888 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.84 
 
 		 933 aa  266  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.12 
 
 		 1688 aa  266  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.09 
 
 		 931 aa  258  5e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  28.76 
 
 		 875 aa  253  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.38 
 
 		 874 aa  251  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.17 
 
 		 1534 aa  249  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.69 
 
 		 874 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.04 
 
 		 872 aa  248  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.17 
 
 		 874 aa  247  9e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.97 
 
 		 1412 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  33.33 
 
 		 1573 aa  245  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.32 
 
 		 1435 aa  245  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.45 
 
 		 873 aa  244  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.95 
 
 		 1502 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.57 
 
 		 870 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  29.36 
 
 		 1544 aa  241  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.02 
 
 		 872 aa  241  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  29.38 
 
 		 1480 aa  240  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  28.94 
 
 		 1567 aa  239  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.44 
 
 		 1495 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.1 
 
 		 1475 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.31 
 
 		 1535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  31.08 
 
 		 1419 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.39 
 
 		 914 aa  233  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  29.23 
 
 		 1506 aa  233  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 1523 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 1517 aa  232  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  29.6 
 
 		 1431 aa  232  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  29.46 
 
 		 1584 aa  231  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  29.06 
 
 		 1523 aa  231  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 		 1523 aa  231  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  30.31 
 
 		 1388 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  27.93 
 
 		 1534 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 		 1514 aa  229  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  29.15 
 
 		 1536 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  30.75 
 
 		 1509 aa  227  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 		 1539 aa  227  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 1553 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.28 
 
 		 1538 aa  225  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 1476 aa  225  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  27.28 
 
 		 1538 aa  225  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  31.93 
 
 		 1606 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1538 aa  225  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.05 
 
 		 1538 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  31.67 
 
 		 1493 aa  224  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.16 
 
 		 1538 aa  224  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  29.18 
 
 		 1536 aa  224  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  27.16 
 
 		 1538 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  28.32 
 
 		 1434 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  33.62 
 
 		 841 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  29 
 
 		 1513 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1426 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.16 
 
 		 1538 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 		 1429 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.16 
 
 		 1525 aa  222  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  33.62 
 
 		 853 aa  222  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  30.91 
 
 		 1549 aa  221  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  28.75 
 
 		 1536 aa  221  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 900 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 1516 aa  220  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  29.55 
 
 		 1572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.52 
 
 		 1598 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.45 
 
 		 1451 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  33.52 
 
 		 1598 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.52 
 
 		 1598 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.52 
 
 		 1598 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  27.54 
 
 		 1618 aa  217  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  27.18 
 
 		 807 aa  216  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.77 
 
 		 1561 aa  217  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.32 
 
 		 811 aa  216  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.61 
 
 		 854 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>