More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0779 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  50.42 
 
 
954 aa  895    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.01 
 
 
909 aa  798    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  52.63 
 
 
955 aa  1014    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  50.37 
 
 
939 aa  926    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.92 
 
 
897 aa  781    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  45.05 
 
 
898 aa  781    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.87 
 
 
944 aa  1040    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.26 
 
 
972 aa  854    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.84 
 
 
903 aa  780    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  48.61 
 
 
943 aa  875    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
932 aa  1885    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.3 
 
 
927 aa  642    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  44.62 
 
 
903 aa  789    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  49.73 
 
 
946 aa  900    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.7 
 
 
890 aa  628  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.71 
 
 
928 aa  622  1e-176  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.04 
 
 
970 aa  612  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.87 
 
 
937 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.45 
 
 
928 aa  614  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
916 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.39 
 
 
916 aa  600  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 
915 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.66 
 
 
926 aa  562  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.96 
 
 
912 aa  556  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
913 aa  553  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
905 aa  487  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.73 
 
 
946 aa  487  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.05 
 
 
913 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  34.88 
 
 
1688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  33.49 
 
 
888 aa  389  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.15 
 
 
875 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
900 aa  366  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  30.66 
 
 
873 aa  365  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.66 
 
 
870 aa  333  9e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.65 
 
 
931 aa  333  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  32.1 
 
 
1480 aa  333  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  31.85 
 
 
1495 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.58 
 
 
872 aa  324  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.64 
 
 
1502 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.29 
 
 
874 aa  318  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.18 
 
 
874 aa  317  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.46 
 
 
874 aa  314  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.25 
 
 
933 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
1476 aa  307  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.06 
 
 
872 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  31.05 
 
 
1435 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 
1553 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  31.45 
 
 
1504 aa  298  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  28.86 
 
 
914 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.04 
 
 
1480 aa  295  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.99 
 
 
1518 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.28 
 
 
1510 aa  293  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.44 
 
 
1505 aa  293  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.7 
 
 
1517 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  30.55 
 
 
1531 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.83 
 
 
1412 aa  290  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.46 
 
 
1497 aa  290  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  34.17 
 
 
1536 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  30.27 
 
 
1573 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.34 
 
 
1388 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.6 
 
 
1429 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.06 
 
 
1506 aa  287  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  34.02 
 
 
1536 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  31.3 
 
 
1431 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  33.88 
 
 
1536 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  29.87 
 
 
1544 aa  283  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  34.38 
 
 
1448 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.83 
 
 
915 aa  282  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
1514 aa  281  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  34.33 
 
 
1448 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  35.05 
 
 
1515 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.94 
 
 
1534 aa  280  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.3 
 
 
1475 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  31.58 
 
 
1523 aa  279  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
1451 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  29.75 
 
 
1523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
1508 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.75 
 
 
1523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  31.02 
 
 
1419 aa  274  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  29.83 
 
 
1434 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.75 
 
 
1523 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.04 
 
 
1381 aa  272  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
1426 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  30.02 
 
 
1584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  28.19 
 
 
922 aa  270  8e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.99 
 
 
1516 aa  270  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  30.63 
 
 
1535 aa  270  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  28.38 
 
 
941 aa  270  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.03 
 
 
701 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.28 
 
 
1598 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  35.28 
 
 
1598 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.28 
 
 
1598 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.28 
 
 
1598 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  35.28 
 
 
1599 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.51 
 
 
1700 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  35.22 
 
 
1598 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  28.09 
 
 
1534 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.26 
 
 
1538 aa  259  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.71 
 
 
1626 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  29.11 
 
 
1513 aa  258  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>