More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4429 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.69 
 
 		 743 aa  755    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  59.78 
 
 		 743 aa  849    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  100 
 
 		 740 aa  1499    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.79 
 
 		 740 aa  779    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  69.95 
 
 		 736 aa  1044    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.93 
 
 		 738 aa  1048    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.75 
 
 		 734 aa  743    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.18 
 
 		 744 aa  853    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  53.1 
 
 		 734 aa  742    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  45.78 
 
 		 723 aa  611  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.47 
 
 		 736 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.56 
 
 		 783 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.55 
 
 		 739 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.37 
 
 		 755 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  43.6 
 
 		 751 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.94 
 
 		 725 aa  536  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  43.88 
 
 		 746 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34 
 
 		 741 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  33.65 
 
 		 740 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  33.56 
 
 		 722 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 		 710 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.93 
 
 		 711 aa  376  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.92 
 
 		 716 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.89 
 
 		 708 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 		 696 aa  291  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.08 
 
 		 701 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.34 
 
 		 706 aa  252  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  31.8 
 
 		 925 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  31.96 
 
 		 925 aa  247  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.97 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 716 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.26 
 
 		 675 aa  217  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 		 698 aa  214  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.1 
 
 		 711 aa  210  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.58 
 
 		 696 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  28.69 
 
 		 943 aa  201  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  29.59 
 
 		 939 aa  200  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.84 
 
 		 694 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  30.77 
 
 		 955 aa  198  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.63 
 
 		 913 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 		 926 aa  196  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.45 
 
 		 972 aa  194  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  32.79 
 
 		 694 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  33.02 
 
 		 702 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  32.25 
 
 		 753 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 928 aa  191  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.31 
 
 		 897 aa  190  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.23 
 
 		 931 aa  189  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.09 
 
 		 933 aa  190  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  31.28 
 
 		 710 aa  190  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.55 
 
 		 890 aa  185  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.09 
 
 		 927 aa  185  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.3 
 
 		 928 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  33.17 
 
 		 898 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 912 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.69 
 
 		 944 aa  182  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.77 
 
 		 916 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.11 
 
 		 909 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.37 
 
 		 970 aa  178  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  27.95 
 
 		 903 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 937 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.6 
 
 		 932 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  26.77 
 
 		 954 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  29.82 
 
 		 875 aa  172  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.24 
 
 		 905 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.33 
 
 		 916 aa  171  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.87 
 
 		 903 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  29.32 
 
 		 946 aa  171  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.76 
 
 		 1688 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.03 
 
 		 913 aa  170  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.37 
 
 		 946 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.1 
 
 		 873 aa  165  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 1534 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.77 
 
 		 1412 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  32.51 
 
 		 872 aa  153  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  29.01 
 
 		 888 aa  153  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.2 
 
 		 915 aa  153  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  27.77 
 
 		 1480 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.95 
 
 		 1502 aa  151  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.5 
 
 		 915 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  26.97 
 
 		 874 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.64 
 
 		 922 aa  150  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.7 
 
 		 872 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  29.51 
 
 		 1604 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.68 
 
 		 1388 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.72 
 
 		 1626 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 1497 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.32 
 
 		 833 aa  147  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.92 
 
 		 874 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  29.45 
 
 		 1598 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.45 
 
 		 1598 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  29.59 
 
 		 1599 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 851 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.45 
 
 		 1598 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.45 
 
 		 1598 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.39 
 
 		 1700 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.24 
 
 		 1480 aa  145  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.64 
 
 		 1516 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  30.2 
 
 		 807 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.81 
 
 		 874 aa  144  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>