More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0304 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.9 
 
 		 1505 aa  2226    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  56.5 
 
 		 1434 aa  888    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  60.78 
 
 		 1412 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.56 
 
 		 1497 aa  1846    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  99.5 
 
 		 1598 aa  3094    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  99.18 
 
 		 1599 aa  2781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 		 1700 aa  3313    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  60.64 
 
 		 1431 aa  1058    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  68.32 
 
 		 1515 aa  2022    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.69 
 
 		 1518 aa  2254    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  90.29 
 
 		 1626 aa  2651    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.07 
 
 		 1480 aa  2128    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  99.5 
 
 		 1598 aa  3094    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  62.29 
 
 		 1448 aa  1035    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  64.42 
 
 		 1510 aa  1940    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.61 
 
 		 1426 aa  891    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  43.7 
 
 		 1435 aa  1115    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  64.8 
 
 		 1504 aa  1127    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.4 
 
 		 1508 aa  2222    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  62.18 
 
 		 1448 aa  1033    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  99.5 
 
 		 1598 aa  3094    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.81 
 
 		 1451 aa  976    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.54 
 
 		 1429 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  99.5 
 
 		 1598 aa  3094    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  99.69 
 
 		 1598 aa  2799    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  59.76 
 
 		 1388 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  59.53 
 
 		 1419 aa  626  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  54.84 
 
 		 1573 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.43 
 
 		 1475 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  42.59 
 
 		 1688 aa  473  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.39 
 
 		 1553 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  46 
 
 		 1480 aa  446  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00432  ATP-dependent DNA helicase  70.5 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  42.35 
 
 		 1531 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  44.34 
 
 		 1536 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  44.66 
 
 		 1536 aa  433  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  44.5 
 
 		 1536 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  42.27 
 
 		 1584 aa  432  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  42.41 
 
 		 888 aa  429  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.71 
 
 		 1523 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  43.51 
 
 		 1523 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.51 
 
 		 1523 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  41.87 
 
 		 1644 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.33 
 
 		 1514 aa  416  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.22 
 
 		 1381 aa  413  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  40.81 
 
 		 1620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  43.26 
 
 		 1535 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  42 
 
 		 1572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.77 
 
 		 1516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  41.18 
 
 		 1549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.49 
 
 		 1517 aa  407  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.12 
 
 		 1534 aa  406  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  41.6 
 
 		 1544 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  40.47 
 
 		 1632 aa  399  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  42.59 
 
 		 1493 aa  400  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.34 
 
 		 1539 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  42.79 
 
 		 1513 aa  396  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  41.61 
 
 		 1567 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  42.18 
 
 		 1606 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  38.59 
 
 		 873 aa  393  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  39.27 
 
 		 1495 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.34 
 
 		 1613 aa  389  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.04 
 
 		 1476 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 		 1694 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.06 
 
 		 1561 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  39.41 
 
 		 1379 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  38.74 
 
 		 874 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  39.97 
 
 		 1538 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  36.99 
 
 		 875 aa  380  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  39.97 
 
 		 1538 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  39.91 
 
 		 1538 aa  380  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  39.79 
 
 		 1523 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  39.83 
 
 		 870 aa  380  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  41.73 
 
 		 1509 aa  379  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  39.75 
 
 		 1538 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  40.71 
 
 		 1534 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  39.97 
 
 		 1538 aa  377  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  39.94 
 
 		 1525 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  39.97 
 
 		 1538 aa  377  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  39.24 
 
 		 1618 aa  377  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  38.87 
 
 		 874 aa  377  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  39.97 
 
 		 1538 aa  377  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  38.87 
 
 		 874 aa  377  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  36.77 
 
 		 872 aa  373  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 		 1502 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  39.37 
 
 		 1506 aa  367  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  38.23 
 
 		 1601 aa  362  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  37.13 
 
 		 1729 aa  361  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  41.2 
 
 		 872 aa  361  8e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  39.46 
 
 		 941 aa  358  6.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  38.24 
 
 		 922 aa  357  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  37.08 
 
 		 915 aa  351  6e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  37.12 
 
 		 914 aa  345  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  35.29 
 
 		 1523 aa  314  9e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.12 
 
 		 900 aa  301  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.54 
 
 		 937 aa  291  8e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.61 
 
 		 927 aa  291  8e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.55 
 
 		 928 aa  284  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.79 
 
 		 928 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  38.32 
 
 		 807 aa  272  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>