More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1508 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  41.37 
 
 		 873 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  41.25 
 
 		 875 aa  663    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  51.68 
 
 		 914 aa  911    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  42.2 
 
 		 1688 aa  693    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  48.69 
 
 		 872 aa  940    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  49.71 
 
 		 1523 aa  849    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  52.51 
 
 		 922 aa  914    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  52.4 
 
 		 874 aa  976    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  50.83 
 
 		 941 aa  866    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  67.43 
 
 		 870 aa  1212    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  44.5 
 
 		 888 aa  732    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  52.4 
 
 		 874 aa  974    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  52.18 
 
 		 915 aa  918    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  51.6 
 
 		 874 aa  966    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  100 
 
 		 872 aa  1777    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  35.16 
 
 		 1480 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1429 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.06 
 
 		 1426 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  33.29 
 
 		 1434 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  33.94 
 
 		 1431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 		 1480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.62 
 
 		 1412 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  34.84 
 
 		 1388 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.14 
 
 		 1497 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  34.14 
 
 		 1435 aa  399  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.83 
 
 		 1451 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  34.99 
 
 		 1419 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.26 
 
 		 1510 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.09 
 
 		 1448 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  32.67 
 
 		 1504 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  35.96 
 
 		 1448 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  32.15 
 
 		 1584 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.85 
 
 		 1475 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  32.3 
 
 		 1573 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.99 
 
 		 1508 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.65 
 
 		 1505 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.28 
 
 		 1518 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.01 
 
 		 900 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.63 
 
 		 1476 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  41.65 
 
 		 1515 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  31.24 
 
 		 1544 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.33 
 
 		 1514 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.67 
 
 		 1517 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.14 
 
 		 1534 aa  363  6e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 		 1516 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.19 
 
 		 1523 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  31.33 
 
 		 1493 aa  362  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 1553 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  31.03 
 
 		 1567 aa  361  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  41.65 
 
 		 1599 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  41.61 
 
 		 1598 aa  361  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.2 
 
 		 1700 aa  360  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  41.65 
 
 		 1598 aa  360  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.65 
 
 		 1598 aa  360  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.65 
 
 		 1598 aa  360  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.65 
 
 		 1598 aa  360  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.48 
 
 		 1626 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  31.06 
 
 		 1523 aa  357  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.42 
 
 		 937 aa  356  1e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.87 
 
 		 1523 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.87 
 
 		 1523 aa  356  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  32.22 
 
 		 1549 aa  353  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.31 
 
 		 1506 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  29.6 
 
 		 1379 aa  350  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  32.63 
 
 		 1606 aa  350  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  30.9 
 
 		 1531 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  30.51 
 
 		 1538 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1538 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.51 
 
 		 1538 aa  348  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.51 
 
 		 1539 aa  348  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  30.51 
 
 		 1538 aa  348  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  31.39 
 
 		 1644 aa  347  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  30.29 
 
 		 1513 aa  347  6e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  31.75 
 
 		 1536 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.29 
 
 		 1538 aa  346  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.18 
 
 		 1538 aa  346  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  32.65 
 
 		 1509 aa  346  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  31.75 
 
 		 1536 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.73 
 
 		 1538 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.17 
 
 		 1613 aa  345  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  31.62 
 
 		 1536 aa  344  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 		 928 aa  343  8e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.04 
 
 		 927 aa  342  2e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.12 
 
 		 1525 aa  342  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  30.4 
 
 		 1601 aa  340  8e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  28.59 
 
 		 1729 aa  337  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  28.7 
 
 		 955 aa  337  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 1561 aa  337  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  30.16 
 
 		 1572 aa  336  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.4 
 
 		 928 aa  335  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.1 
 
 		 1535 aa  335  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.4 
 
 		 970 aa  335  3e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.88 
 
 		 1694 aa  334  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.13 
 
 		 1381 aa  333  9e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 		 916 aa  330  6e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.02 
 
 		 1495 aa  327  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  29.82 
 
 		 1618 aa  327  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.58 
 
 		 932 aa  324  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.51 
 
 		 944 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.85 
 
 		 972 aa  320  9e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>