More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1076 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
725 aa  1478    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.92 
 
 
744 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  41.94 
 
 
740 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.42 
 
 
738 aa  525  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  42.82 
 
 
736 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 
743 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.22 
 
 
734 aa  515  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.19 
 
 
783 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  40.79 
 
 
743 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.81 
 
 
736 aa  485  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  40.42 
 
 
734 aa  485  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 
740 aa  479  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  43.98 
 
 
723 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  39.3 
 
 
751 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.14 
 
 
755 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 
739 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.22 
 
 
711 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  40.36 
 
 
746 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  35.12 
 
 
740 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  36.31 
 
 
722 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.98 
 
 
741 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
710 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 
716 aa  353  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.01 
 
 
708 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.4 
 
 
696 aa  273  6e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.67 
 
 
701 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  32.8 
 
 
925 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  32.59 
 
 
925 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.63 
 
 
706 aa  228  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.39 
 
 
711 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.55 
 
 
716 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.28 
 
 
696 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.06 
 
 
711 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.92 
 
 
698 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.23 
 
 
694 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  29.95 
 
 
694 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.62 
 
 
913 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.72 
 
 
675 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  30.65 
 
 
710 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  29.15 
 
 
702 aa  180  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.39 
 
 
890 aa  178  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.9 
 
 
931 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  30.11 
 
 
753 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  27.62 
 
 
943 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.15 
 
 
916 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.42 
 
 
913 aa  165  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  27.26 
 
 
939 aa  164  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 
903 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
912 aa  162  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.79 
 
 
905 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.5 
 
 
916 aa  160  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.06 
 
 
972 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.88 
 
 
933 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.73 
 
 
926 aa  157  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.97 
 
 
897 aa  157  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  31.53 
 
 
898 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.69 
 
 
932 aa  153  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  27.37 
 
 
955 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  25.36 
 
 
903 aa  148  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.22 
 
 
970 aa  147  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29 
 
 
1495 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.28 
 
 
806 aa  147  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.94 
 
 
801 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  26.71 
 
 
1688 aa  147  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  26.95 
 
 
873 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  26.3 
 
 
946 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.71 
 
 
946 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.34 
 
 
1412 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  29.4 
 
 
799 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.37 
 
 
944 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  26.32 
 
 
954 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.35 
 
 
909 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 
1516 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
799 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  27.47 
 
 
1531 aa  138  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  30.08 
 
 
807 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.04 
 
 
799 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.24 
 
 
1514 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  33.17 
 
 
941 aa  135  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  30.79 
 
 
914 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.7 
 
 
888 aa  135  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  26.4 
 
 
1534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.95 
 
 
915 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 
1534 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.89 
 
 
927 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.41 
 
 
922 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  34.36 
 
 
804 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.04 
 
 
915 aa  134  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 
937 aa  134  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.47 
 
 
928 aa  134  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.98 
 
 
1502 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.66 
 
 
854 aa  132  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  30.51 
 
 
1573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.18 
 
 
820 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  28.57 
 
 
1480 aa  130  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.75 
 
 
809 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.61 
 
 
928 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31.58 
 
 
872 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.33 
 
 
833 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  33.13 
 
 
835 aa  129  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>