More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2792 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.09 
 
 		 836 aa  787    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.17 
 
 		 851 aa  838    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  51.09 
 
 		 836 aa  789    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.27 
 
 		 851 aa  801    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  51.81 
 
 		 908 aa  739    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  53.21 
 
 		 835 aa  786    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  51.82 
 
 		 834 aa  803    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  52.72 
 
 		 890 aa  802    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  52.56 
 
 		 799 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.37 
 
 		 799 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  52.06 
 
 		 846 aa  800    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.59 
 
 		 809 aa  853    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.81 
 
 		 851 aa  832    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.97 
 
 		 847 aa  789    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  49.07 
 
 		 937 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  68.5 
 
 		 804 aa  1089    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  50.25 
 
 		 807 aa  778    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  50.82 
 
 		 905 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  53.11 
 
 		 951 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  49.88 
 
 		 904 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  50.86 
 
 		 853 aa  777    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  70.07 
 
 		 806 aa  1120    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  52.49 
 
 		 839 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.89 
 
 		 849 aa  835    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.38 
 
 		 884 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  52.23 
 
 		 853 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 801 aa  1607    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.88 
 
 		 811 aa  740    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  51.56 
 
 		 841 aa  824    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.69 
 
 		 824 aa  825    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.75 
 
 		 930 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  45.5 
 
 		 868 aa  742    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  51.31 
 
 		 807 aa  779    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.94 
 
 		 846 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  53.45 
 
 		 835 aa  835    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.43 
 
 		 799 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.16 
 
 		 851 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.96 
 
 		 898 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.9 
 
 		 833 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.19 
 
 		 844 aa  452  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  37.71 
 
 		 825 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  36.97 
 
 		 952 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  37.56 
 
 		 833 aa  438  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.49 
 
 		 830 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  35.89 
 
 		 869 aa  439  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  36 
 
 		 881 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.96 
 
 		 870 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  36.21 
 
 		 882 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 		 819 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  33.95 
 
 		 831 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  35.49 
 
 		 836 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  32.97 
 
 		 824 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  32.06 
 
 		 813 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  33.21 
 
 		 823 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  35.45 
 
 		 829 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.62 
 
 		 816 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.3 
 
 		 816 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 		 817 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.62 
 
 		 816 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  32.54 
 
 		 820 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.17 
 
 		 820 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 966 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.27 
 
 		 888 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  35.15 
 
 		 970 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.29 
 
 		 1014 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.03 
 
 		 970 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  30.51 
 
 		 828 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 828 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.99 
 
 		 828 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.74 
 
 		 825 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  36.13 
 
 		 819 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  29.94 
 
 		 840 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.25 
 
 		 900 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.25 
 
 		 888 aa  302  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 		 1517 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.16 
 
 		 1514 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.92 
 
 		 1513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.3 
 
 		 1523 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.3 
 
 		 1523 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 1523 aa  271  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  27.07 
 
 		 1688 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.99 
 
 		 874 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.08 
 
 		 873 aa  266  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.03 
 
 		 1497 aa  265  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.52 
 
 		 1535 aa  263  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.27 
 
 		 870 aa  263  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  29.79 
 
 		 1531 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.57 
 
 		 1506 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  28.76 
 
 		 1495 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.78 
 
 		 874 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.92 
 
 		 874 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  29.68 
 
 		 1480 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  38.92 
 
 		 1504 aa  259  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.87 
 
 		 1412 aa  257  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.86 
 
 		 872 aa  257  8e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.58 
 
 		 1510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  33.85 
 
 		 1448 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 		 1476 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  30.65 
 
 		 875 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  35.37 
 
 		 1448 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>