More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1517 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.12 
 
 		 870 aa  981    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.22 
 
 		 820 aa  741    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.77 
 
 		 819 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.09 
 
 		 833 aa  870    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  63.18 
 
 		 816 aa  975    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  62.89 
 
 		 836 aa  993    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  62.99 
 
 		 830 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.16 
 
 		 966 aa  925    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  65.62 
 
 		 898 aa  1011    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  61.74 
 
 		 881 aa  960    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  63.57 
 
 		 952 aa  982    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.36 
 
 		 817 aa  969    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  63.29 
 
 		 829 aa  993    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  42.72 
 
 		 840 aa  699    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  44.13 
 
 		 824 aa  696    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  44.14 
 
 		 831 aa  666    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  61.36 
 
 		 882 aa  955    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  45.33 
 
 		 820 aa  739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.78 
 
 		 888 aa  948    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.06 
 
 		 816 aa  969    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  45.53 
 
 		 823 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  46.32 
 
 		 813 aa  774    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  50.85 
 
 		 819 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  54.39 
 
 		 869 aa  892    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  60.21 
 
 		 970 aa  938    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  52.68 
 
 		 833 aa  764    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.71 
 
 		 1014 aa  926    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.55 
 
 		 970 aa  946    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.3 
 
 		 816 aa  959    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  100 
 
 		 825 aa  1617    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.25 
 
 		 844 aa  879    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 		 828 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.36 
 
 		 828 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  37.21 
 
 		 828 aa  628  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.82 
 
 		 825 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.65 
 
 		 801 aa  462  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  36.97 
 
 		 846 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  36.43 
 
 		 904 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  37.68 
 
 		 804 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.26 
 
 		 849 aa  428  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.5 
 
 		 809 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.01 
 
 		 846 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.15 
 
 		 806 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  34.22 
 
 		 835 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  36.74 
 
 		 905 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.6 
 
 		 851 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  35.48 
 
 		 834 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  36.79 
 
 		 835 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  35.99 
 
 		 807 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  34.95 
 
 		 839 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.73 
 
 		 824 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 884 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  36.02 
 
 		 853 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  35.16 
 
 		 836 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.28 
 
 		 836 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  34.26 
 
 		 841 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  34.3 
 
 		 853 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  35.59 
 
 		 937 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  35 
 
 		 807 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  36.47 
 
 		 908 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.51 
 
 		 851 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.14 
 
 		 847 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  37.03 
 
 		 799 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  31.51 
 
 		 868 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  35.91 
 
 		 951 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  36.22 
 
 		 890 aa  389  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.29 
 
 		 851 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 		 799 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 		 799 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 		 811 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 		 930 aa  353  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.05 
 
 		 900 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.21 
 
 		 888 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.28 
 
 		 1688 aa  300  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  27.36 
 
 		 875 aa  292  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.47 
 
 		 874 aa  292  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.36 
 
 		 874 aa  292  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.03 
 
 		 874 aa  292  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.58 
 
 		 872 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.95 
 
 		 915 aa  287  5e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.33 
 
 		 851 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.96 
 
 		 922 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.43 
 
 		 873 aa  282  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.59 
 
 		 870 aa  281  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.34 
 
 		 872 aa  273  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 		 1476 aa  267  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  31.53 
 
 		 1480 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  29.29 
 
 		 941 aa  261  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.86 
 
 		 1517 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1514 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.08 
 
 		 914 aa  259  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.37 
 
 		 1506 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 1523 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.97 
 
 		 1523 aa  247  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 1523 aa  247  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  31.26 
 
 		 1632 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.43 
 
 		 1538 aa  243  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.97 
 
 		 1516 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  30.76 
 
 		 1567 aa  241  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.57 
 
 		 916 aa  240  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>