More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0232 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.25 
 
 
851 aa  959    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.74 
 
 
930 aa  930    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  74.67 
 
 
851 aa  1264    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  65.09 
 
 
834 aa  1076    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.95 
 
 
847 aa  983    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  63.52 
 
 
835 aa  1025    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.36 
 
 
801 aa  837    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  49.82 
 
 
799 aa  764    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  79.18 
 
 
835 aa  1342    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.53 
 
 
884 aa  1412    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.63 
 
 
846 aa  1014    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  58.61 
 
 
937 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  52.2 
 
 
804 aa  820    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.57 
 
 
799 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  47.82 
 
 
807 aa  758    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  64.91 
 
 
905 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  96.43 
 
 
841 aa  1627    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  61.5 
 
 
904 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  63.58 
 
 
853 aa  1040    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  63.57 
 
 
846 aa  1032    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.39 
 
 
806 aa  824    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  72.97 
 
 
839 aa  1255    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.43 
 
 
849 aa  1020    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 
853 aa  1734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  60.8 
 
 
951 aa  1059    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.89 
 
 
851 aa  1014    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  49.33 
 
 
807 aa  787    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
811 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  64.97 
 
 
836 aa  1072    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  61.49 
 
 
890 aa  1005    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.73 
 
 
836 aa  1070    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  47.93 
 
 
868 aa  804    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.07 
 
 
851 aa  1235    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.71 
 
 
809 aa  860    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.45 
 
 
799 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  60.51 
 
 
908 aa  1049    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.95 
 
 
824 aa  962    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  36.49 
 
 
869 aa  466  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.89 
 
 
844 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.8 
 
 
830 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
833 aa  432  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
816 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  35.22 
 
 
952 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.15 
 
 
817 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.4 
 
 
816 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  35.45 
 
 
833 aa  422  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  35.15 
 
 
836 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  33.74 
 
 
823 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  34.16 
 
 
831 aa  416  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
819 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.8 
 
 
816 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.49 
 
 
820 aa  408  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  32.93 
 
 
820 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  33.82 
 
 
829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  33.17 
 
 
824 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.78 
 
 
898 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  34.42 
 
 
825 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.52 
 
 
966 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
828 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  31.17 
 
 
813 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.44 
 
 
870 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.9 
 
 
828 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  34.48 
 
 
819 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  29.93 
 
 
828 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.74 
 
 
970 aa  386  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.49 
 
 
825 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 
888 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  33.14 
 
 
882 aa  383  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  33.41 
 
 
970 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  32.67 
 
 
881 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.81 
 
 
1014 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  29.37 
 
 
840 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 
900 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.6 
 
 
1688 aa  326  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.4 
 
 
888 aa  313  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  29.21 
 
 
1523 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.21 
 
 
1523 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
1517 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  27.14 
 
 
875 aa  266  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.04 
 
 
1523 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  28.38 
 
 
922 aa  266  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.22 
 
 
1412 aa  265  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.71 
 
 
873 aa  262  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  29.48 
 
 
941 aa  261  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
1514 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.99 
 
 
1476 aa  260  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  29.4 
 
 
1506 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  30.13 
 
 
1513 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  29.37 
 
 
1531 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.21 
 
 
927 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  30.22 
 
 
1544 aa  254  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  28.86 
 
 
915 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.05 
 
 
874 aa  253  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.76 
 
 
937 aa  251  5e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.77 
 
 
972 aa  251  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.48 
 
 
1480 aa  250  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.15 
 
 
928 aa  250  9e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.73 
 
 
874 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.5 
 
 
872 aa  249  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.79 
 
 
928 aa  248  4e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>