More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0312 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.23 
 
 		 966 aa  1349    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  57.72 
 
 		 881 aa  929    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.54 
 
 		 817 aa  962    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  39.39 
 
 		 840 aa  636    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.46 
 
 		 833 aa  814    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.82 
 
 		 816 aa  961    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  60 
 
 		 836 aa  972    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.84 
 
 		 816 aa  946    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  59.75 
 
 		 830 aa  979    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  61.06 
 
 		 898 aa  1030    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  70.09 
 
 		 952 aa  1118    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  51.18 
 
 		 869 aa  832    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  59.77 
 
 		 829 aa  986    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.43 
 
 		 819 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  41.39 
 
 		 824 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  41.54 
 
 		 823 aa  683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.66 
 
 		 820 aa  679    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  57.53 
 
 		 882 aa  929    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  41.99 
 
 		 813 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.36 
 
 		 816 aa  951    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  98.14 
 
 		 970 aa  1862    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  47.98 
 
 		 833 aa  678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.75 
 
 		 870 aa  946    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.42 
 
 		 888 aa  906    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  42.15 
 
 		 820 aa  685    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.23 
 
 		 1014 aa  1355    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.03 
 
 		 844 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 970 aa  1900    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  60.89 
 
 		 825 aa  961    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  41.33 
 
 		 831 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  46.9 
 
 		 819 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.75 
 
 		 828 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.75 
 
 		 828 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  35.52 
 
 		 828 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 		 825 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  34.2 
 
 		 835 aa  416  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.47 
 
 		 824 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.67 
 
 		 846 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.03 
 
 		 851 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  36.04 
 
 		 804 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  35.17 
 
 		 846 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 851 aa  399  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  33.37 
 
 		 841 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  33.74 
 
 		 853 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  34.31 
 
 		 834 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  34.17 
 
 		 836 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.32 
 
 		 806 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.28 
 
 		 836 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  33.14 
 
 		 839 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.53 
 
 		 849 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  34.75 
 
 		 807 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 847 aa  389  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.11 
 
 		 851 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 		 809 aa  382  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  36.25 
 
 		 799 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.01 
 
 		 884 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  33.15 
 
 		 904 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  32.57 
 
 		 908 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.01 
 
 		 811 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  33.15 
 
 		 807 aa  366  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  33.45 
 
 		 853 aa  365  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  30.58 
 
 		 868 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.9 
 
 		 799 aa  363  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  33.55 
 
 		 951 aa  362  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  31.73 
 
 		 937 aa  360  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  33.9 
 
 		 890 aa  360  7e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 		 799 aa  360  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  34.4 
 
 		 835 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  33.9 
 
 		 905 aa  356  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.05 
 
 		 930 aa  353  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 900 aa  324  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 851 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  28.24 
 
 		 888 aa  291  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.51 
 
 		 1688 aa  257  7e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  24.39 
 
 		 875 aa  254  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  24.31 
 
 		 872 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  25.9 
 
 		 873 aa  253  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.91 
 
 		 922 aa  245  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  24.36 
 
 		 874 aa  244  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  24.6 
 
 		 874 aa  241  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  25.03 
 
 		 874 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.46 
 
 		 915 aa  234  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  28.3 
 
 		 941 aa  233  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  27.68 
 
 		 872 aa  232  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.31 
 
 		 1480 aa  228  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  26.39 
 
 		 870 aa  228  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  26.2 
 
 		 914 aa  226  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  29.07 
 
 		 1506 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  33.66 
 
 		 1448 aa  218  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.56 
 
 		 1523 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1518 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.56 
 
 		 1523 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.56 
 
 		 1523 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.97 
 
 		 916 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.06 
 
 		 932 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.23 
 
 		 1626 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.78 
 
 		 1598 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  33.78 
 
 		 1598 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.78 
 
 		 1598 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>