More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6864 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  46.72 
 
 		 952 aa  722    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.32 
 
 		 966 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.56 
 
 		 816 aa  691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  45.07 
 
 		 836 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.91 
 
 		 830 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.48 
 
 		 819 aa  916    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.66 
 
 		 898 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.1 
 
 		 844 aa  818    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  45.51 
 
 		 829 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.18 
 
 		 888 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  42.82 
 
 		 824 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  41.26 
 
 		 831 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.55 
 
 		 817 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.56 
 
 		 816 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  42.67 
 
 		 833 aa  672    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  52.43 
 
 		 823 aa  868    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  45.24 
 
 		 881 aa  735    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  45.01 
 
 		 882 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.03 
 
 		 820 aa  891    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  60.02 
 
 		 840 aa  1044    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  55.12 
 
 		 813 aa  947    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 		 820 aa  1692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.85 
 
 		 833 aa  810    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  47.34 
 
 		 869 aa  788    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.51 
 
 		 1014 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.03 
 
 		 870 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.8 
 
 		 970 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  45.33 
 
 		 825 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.5 
 
 		 816 aa  693    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  41.92 
 
 		 970 aa  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  41.94 
 
 		 819 aa  631  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  40.12 
 
 		 828 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 		 828 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 		 828 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.54 
 
 		 825 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  33.29 
 
 		 904 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 		 851 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 		 849 aa  422  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 804 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  32.61 
 
 		 853 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  32.65 
 
 		 839 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  33.05 
 
 		 835 aa  415  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  32.8 
 
 		 937 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  34.52 
 
 		 905 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  31.39 
 
 		 951 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  34.42 
 
 		 908 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  32.2 
 
 		 834 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.48 
 
 		 846 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  32.07 
 
 		 846 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.7 
 
 		 806 aa  405  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  32.93 
 
 		 853 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 836 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.72 
 
 		 851 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  31.67 
 
 		 836 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  32.65 
 
 		 841 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 		 884 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  33.41 
 
 		 835 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.85 
 
 		 851 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.93 
 
 		 824 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  31.29 
 
 		 868 aa  396  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  33.46 
 
 		 890 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 		 809 aa  392  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.29 
 
 		 847 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  31.46 
 
 		 807 aa  372  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.79 
 
 		 851 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  32.09 
 
 		 807 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.14 
 
 		 811 aa  346  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 		 930 aa  346  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  32.11 
 
 		 799 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 		 799 aa  340  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  31.14 
 
 		 1688 aa  339  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.85 
 
 		 799 aa  333  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.96 
 
 		 888 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.99 
 
 		 900 aa  323  9.000000000000001e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.76 
 
 		 915 aa  286  8e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  28.73 
 
 		 875 aa  283  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  30.07 
 
 		 872 aa  279  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.58 
 
 		 914 aa  278  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.34 
 
 		 870 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  27.37 
 
 		 941 aa  273  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.43 
 
 		 874 aa  271  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.92 
 
 		 922 aa  271  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  28.26 
 
 		 873 aa  270  8e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.31 
 
 		 874 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.12 
 
 		 874 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  28.41 
 
 		 872 aa  258  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  29.22 
 
 		 1379 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 1517 aa  241  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.93 
 
 		 1381 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  27.64 
 
 		 1480 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.11 
 
 		 1514 aa  233  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  25.89 
 
 		 1523 aa  231  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  26.47 
 
 		 1573 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.68 
 
 		 1429 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.09 
 
 		 890 aa  229  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  30.81 
 
 		 955 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.03 
 
 		 1434 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  27.96 
 
 		 1584 aa  224  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.47 
 
 		 1538 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>