More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0202 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.41 
 
 		 930 aa  943    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.12 
 
 		 846 aa  1011    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  74.24 
 
 		 851 aa  1258    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  60.85 
 
 		 908 aa  1058    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  64.22 
 
 		 836 aa  1063    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  62.84 
 
 		 835 aa  1025    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  79.06 
 
 		 835 aa  1339    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.37 
 
 		 824 aa  960    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  61.93 
 
 		 951 aa  1064    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  49.51 
 
 		 799 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  47.65 
 
 		 868 aa  799    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  82.33 
 
 		 884 aa  1418    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.6 
 
 		 851 aa  966    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.8 
 
 		 801 aa  830    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  58.83 
 
 		 937 aa  1041    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  51.5 
 
 		 804 aa  813    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  49.03 
 
 		 807 aa  779    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  48.01 
 
 		 807 aa  759    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  63.05 
 
 		 905 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.66 
 
 		 809 aa  846    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 		 841 aa  1713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  63.43 
 
 		 846 aa  1029    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  61.62 
 
 		 904 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  63.32 
 
 		 853 aa  1038    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.24 
 
 		 847 aa  989    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.08 
 
 		 806 aa  820    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  72.74 
 
 		 839 aa  1252    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.81 
 
 		 849 aa  1003    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  96.43 
 
 		 853 aa  1627    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.46 
 
 		 811 aa  747    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.22 
 
 		 836 aa  1060    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.57 
 
 		 851 aa  1007    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.75 
 
 		 851 aa  1234    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.15 
 
 		 799 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  64.38 
 
 		 834 aa  1062    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.27 
 
 		 799 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  61.12 
 
 		 890 aa  1005    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  36.44 
 
 		 869 aa  456  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.2 
 
 		 844 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.39 
 
 		 833 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.5 
 
 		 830 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.47 
 
 		 816 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.34 
 
 		 816 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.02 
 
 		 817 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  34.61 
 
 		 952 aa  419  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  34.92 
 
 		 833 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  33.85 
 
 		 829 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  33.82 
 
 		 831 aa  411  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  34.67 
 
 		 836 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  33.86 
 
 		 824 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  33.13 
 
 		 823 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.79 
 
 		 898 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  34.26 
 
 		 825 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  32.65 
 
 		 820 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.11 
 
 		 820 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 		 819 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 		 816 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  31.3 
 
 		 813 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.6 
 
 		 870 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.52 
 
 		 828 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.48 
 
 		 966 aa  389  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 828 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.45 
 
 		 888 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  29.63 
 
 		 828 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.37 
 
 		 970 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  34.23 
 
 		 819 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.06 
 
 		 825 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  33.33 
 
 		 882 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  33.49 
 
 		 881 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  33.03 
 
 		 970 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  29.29 
 
 		 840 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.04 
 
 		 1014 aa  342  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.85 
 
 		 900 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.9 
 
 		 1688 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.46 
 
 		 888 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  30.05 
 
 		 1523 aa  268  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 		 1523 aa  268  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 1517 aa  266  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  29.35 
 
 		 941 aa  266  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.88 
 
 		 1523 aa  266  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  27.19 
 
 		 875 aa  264  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  28.52 
 
 		 922 aa  263  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 1476 aa  259  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.26 
 
 		 915 aa  258  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.43 
 
 		 873 aa  258  4e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 1514 aa  257  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  30.26 
 
 		 1506 aa  257  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.16 
 
 		 1412 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  29.94 
 
 		 1513 aa  254  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.86 
 
 		 872 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.19 
 
 		 972 aa  254  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 		 937 aa  252  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  26.9 
 
 		 874 aa  251  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.42 
 
 		 1480 aa  250  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.39 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.86 
 
 		 874 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  29.06 
 
 		 1531 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.45 
 
 		 928 aa  248  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.02 
 
 		 870 aa  247  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 		 928 aa  246  9e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>