More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0530 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  48.59 
 
 		 868 aa  811    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.9 
 
 		 851 aa  965    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.69 
 
 		 851 aa  985    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.32 
 
 		 851 aa  970    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  60.43 
 
 		 835 aa  946    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  59.72 
 
 		 846 aa  952    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.98 
 
 		 851 aa  838    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.89 
 
 		 801 aa  835    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  52.3 
 
 		 799 aa  781    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  50.18 
 
 		 807 aa  780    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  57.73 
 
 		 908 aa  943    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.59 
 
 		 884 aa  989    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  56.55 
 
 		 937 aa  944    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  53.99 
 
 		 804 aa  835    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  47.85 
 
 		 807 aa  743    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  61.41 
 
 		 905 aa  919    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  59.83 
 
 		 835 aa  972    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  57.28 
 
 		 834 aa  923    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  59.91 
 
 		 904 aa  962    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  59.95 
 
 		 853 aa  955    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.54 
 
 		 836 aa  926    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.69 
 
 		 806 aa  823    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  61.19 
 
 		 839 aa  1006    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  56.4 
 
 		 951 aa  919    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 849 aa  1713    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58 
 
 		 809 aa  876    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  58.43 
 
 		 890 aa  913    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.74 
 
 		 824 aa  943    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  59.69 
 
 		 841 aa  991    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 811 aa  749    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.61 
 
 		 846 aa  930    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  60.31 
 
 		 853 aa  1008    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.62 
 
 		 847 aa  906    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  57.54 
 
 		 836 aa  926    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.74 
 
 		 799 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.31 
 
 		 930 aa  834    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.3 
 
 		 799 aa  770    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  37.68 
 
 		 869 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.58 
 
 		 833 aa  458  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.7 
 
 		 870 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  37.53 
 
 		 833 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.09 
 
 		 816 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.55 
 
 		 830 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.98 
 
 		 816 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 		 844 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.7 
 
 		 817 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  36.52 
 
 		 829 aa  436  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.69 
 
 		 816 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  33.5 
 
 		 823 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  37.59 
 
 		 836 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 819 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.07 
 
 		 898 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  34.71 
 
 		 831 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  36.02 
 
 		 952 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 		 888 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  33.87 
 
 		 820 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  38.26 
 
 		 825 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  34.09 
 
 		 824 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  35.78 
 
 		 881 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  30.86 
 
 		 813 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  37.58 
 
 		 819 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  36.22 
 
 		 882 aa  412  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.7 
 
 		 820 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  30.53 
 
 		 828 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 828 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 		 828 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.38 
 
 		 966 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.6 
 
 		 825 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  30.75 
 
 		 840 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  35.84 
 
 		 970 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.76 
 
 		 970 aa  369  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 900 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.61 
 
 		 1014 aa  350  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  29.52 
 
 		 1688 aa  311  4e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  27.88 
 
 		 888 aa  290  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.22 
 
 		 873 aa  284  5.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  26.37 
 
 		 875 aa  266  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1517 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  28.57 
 
 		 1538 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1538 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.57 
 
 		 1538 aa  248  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  28.57 
 
 		 1538 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.54 
 
 		 922 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.86 
 
 		 1538 aa  247  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.67 
 
 		 1538 aa  247  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  30.37 
 
 		 1513 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.54 
 
 		 1525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 1514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  33.67 
 
 		 1515 aa  245  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.34 
 
 		 1534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 1476 aa  244  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.44 
 
 		 1538 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.56 
 
 		 1523 aa  243  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.56 
 
 		 1523 aa  243  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 		 1518 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.53 
 
 		 1505 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.66 
 
 		 915 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 		 1508 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  28.36 
 
 		 914 aa  239  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 		 1480 aa  237  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>