More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3332 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  48.66 
 
 
869 aa  806    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.34 
 
 
816 aa  736    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  46.52 
 
 
836 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.98 
 
 
830 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45.11 
 
 
898 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  46.2 
 
 
829 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  43.26 
 
 
824 aa  697    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  42.7 
 
 
831 aa  670    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  41.25 
 
 
828 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  52.55 
 
 
820 aa  888    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.64 
 
 
819 aa  892    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.87 
 
 
816 aa  728    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45 
 
 
816 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.54 
 
 
966 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  45.82 
 
 
882 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  45.45 
 
 
881 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  54.58 
 
 
813 aa  911    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 
823 aa  1701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.58 
 
 
828 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  48.49 
 
 
840 aa  820    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.46 
 
 
888 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  45.37 
 
 
952 aa  726    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.96 
 
 
833 aa  814    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.11 
 
 
817 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.75 
 
 
870 aa  721    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  41.1 
 
 
970 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.09 
 
 
1014 aa  678    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.49 
 
 
844 aa  819    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.33 
 
 
970 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
828 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  45.67 
 
 
825 aa  751    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.34 
 
 
820 aa  882    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.34 
 
 
825 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  41.37 
 
 
833 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  39.51 
 
 
819 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  34.39 
 
 
846 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
849 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
846 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.79 
 
 
851 aa  442  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  33.78 
 
 
834 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.34 
 
 
851 aa  429  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 
801 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  33.29 
 
 
836 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.41 
 
 
836 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 
884 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  33.74 
 
 
853 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.17 
 
 
851 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  33.62 
 
 
835 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  32.79 
 
 
904 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  32.6 
 
 
839 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  33.13 
 
 
841 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  32.41 
 
 
853 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.55 
 
 
806 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
824 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  33.21 
 
 
835 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  31.52 
 
 
804 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.78 
 
 
851 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  34.3 
 
 
905 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  33.9 
 
 
908 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  30.65 
 
 
937 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  32.48 
 
 
890 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  30.55 
 
 
951 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 
847 aa  389  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  29.76 
 
 
868 aa  386  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.98 
 
 
809 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  31.62 
 
 
807 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  31.33 
 
 
807 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.97 
 
 
930 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  30.54 
 
 
799 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.93 
 
 
799 aa  357  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.64 
 
 
811 aa  351  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.8 
 
 
799 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.79 
 
 
1688 aa  347  7e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.11 
 
 
900 aa  340  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.81 
 
 
888 aa  335  1e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  28.07 
 
 
875 aa  278  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.04 
 
 
922 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  28.17 
 
 
873 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.53 
 
 
915 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  26.4 
 
 
941 aa  254  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.18 
 
 
872 aa  251  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  27.13 
 
 
870 aa  251  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.78 
 
 
1412 aa  250  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  27.74 
 
 
874 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  32.92 
 
 
1573 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  29.37 
 
 
1480 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.43 
 
 
874 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.42 
 
 
874 aa  245  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  26.65 
 
 
914 aa  244  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 
1429 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  33.72 
 
 
1448 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.22 
 
 
1626 aa  241  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  32.94 
 
 
1599 aa  241  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.88 
 
 
1700 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
928 aa  240  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  33.61 
 
 
1448 aa  240  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.94 
 
 
1598 aa  240  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  32.94 
 
 
1598 aa  240  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.94 
 
 
1598 aa  240  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.94 
 
 
1598 aa  240  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>