More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0376 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  78.37 
 
 		 966 aa  1448    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.37 
 
 		 888 aa  924    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.94 
 
 		 816 aa  954    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  54.67 
 
 		 836 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.99 
 
 		 830 aa  912    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  59.57 
 
 		 898 aa  991    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  56.53 
 
 		 829 aa  972    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.86 
 
 		 816 aa  874    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  40.51 
 
 		 820 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.03 
 
 		 870 aa  915    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.72 
 
 		 816 aa  947    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  55.68 
 
 		 882 aa  949    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.36 
 
 		 820 aa  676    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.69 
 
 		 817 aa  875    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  73.49 
 
 		 970 aa  1321    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  41.07 
 
 		 813 aa  717    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  51.16 
 
 		 869 aa  837    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  45.12 
 
 		 833 aa  679    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.71 
 
 		 833 aa  810    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  65.87 
 
 		 952 aa  1130    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1014 aa  1998    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.16 
 
 		 844 aa  830    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.93 
 
 		 970 aa  1332    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  57.16 
 
 		 825 aa  932    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  55.01 
 
 		 881 aa  942    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  39.67 
 
 		 823 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  37.69 
 
 		 840 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  39.04 
 
 		 824 aa  621  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 828 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.88 
 
 		 819 aa  589  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 828 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.96 
 
 		 825 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  42.68 
 
 		 831 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  32.75 
 
 		 828 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  47.59 
 
 		 819 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  32.82 
 
 		 835 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.4 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.75 
 
 		 806 aa  396  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  32.93 
 
 		 853 aa  386  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  32.78 
 
 		 841 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.44 
 
 		 851 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 		 851 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  33.8 
 
 		 846 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 836 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  32.72 
 
 		 836 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  32.31 
 
 		 834 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  29.73 
 
 		 868 aa  370  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.21 
 
 		 851 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 846 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.7 
 
 		 849 aa  360  7e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 884 aa  360  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  35.48 
 
 		 908 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  33.08 
 
 		 853 aa  357  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.23 
 
 		 930 aa  357  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.31 
 
 		 809 aa  355  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  35.09 
 
 		 951 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  34.72 
 
 		 937 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  35.47 
 
 		 807 aa  353  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.28 
 
 		 824 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  33.92 
 
 		 835 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  34.38 
 
 		 904 aa  349  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  36.79 
 
 		 804 aa  348  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.44 
 
 		 900 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 847 aa  345  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  33.59 
 
 		 799 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  30.87 
 
 		 890 aa  343  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  35.05 
 
 		 839 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  37.68 
 
 		 905 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 		 851 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.3 
 
 		 799 aa  328  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  34.48 
 
 		 807 aa  327  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.65 
 
 		 811 aa  322  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.85 
 
 		 799 aa  317  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  28.69 
 
 		 888 aa  304  6.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.82 
 
 		 1688 aa  252  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  24.69 
 
 		 872 aa  229  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  26.37 
 
 		 873 aa  227  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.43 
 
 		 874 aa  225  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  26.98 
 
 		 870 aa  225  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  25.82 
 
 		 874 aa  224  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  26.27 
 
 		 874 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  23.86 
 
 		 875 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  27.9 
 
 		 872 aa  221  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  28.14 
 
 		 1523 aa  220  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  32.65 
 
 		 1448 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  28.67 
 
 		 922 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.68 
 
 		 1497 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.27 
 
 		 1412 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.61 
 
 		 1598 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.61 
 
 		 1700 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  32.61 
 
 		 1598 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.61 
 
 		 1598 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.61 
 
 		 1598 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  32.61 
 
 		 1599 aa  211  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  32.61 
 
 		 1598 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.24 
 
 		 932 aa  209  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.51 
 
 		 915 aa  209  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  33.23 
 
 		 1448 aa  208  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  28.89 
 
 		 941 aa  208  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 1518 aa  207  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>