More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1253 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  100 
 
 		 941 aa  1882    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  48.72 
 
 		 874 aa  897    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  66.3 
 
 		 915 aa  1222    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  46.83 
 
 		 872 aa  888    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  64.11 
 
 		 1523 aa  1106    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  50.89 
 
 		 870 aa  881    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  41.12 
 
 		 888 aa  647    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  67.9 
 
 		 914 aa  1254    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  48.5 
 
 		 874 aa  895    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  48.28 
 
 		 874 aa  895    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  50.83 
 
 		 872 aa  866    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  65.02 
 
 		 922 aa  1193    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  37.87 
 
 		 1688 aa  592  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  37.33 
 
 		 873 aa  573  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  36.28 
 
 		 875 aa  562  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  36.51 
 
 		 1388 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  37.03 
 
 		 1419 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.77 
 
 		 1510 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  33.48 
 
 		 1434 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.37 
 
 		 1429 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  33.78 
 
 		 1504 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  33.08 
 
 		 1435 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.26 
 
 		 1426 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 		 1475 aa  393  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.15 
 
 		 1497 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  33.37 
 
 		 1573 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.3 
 
 		 1518 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 1480 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  33.11 
 
 		 1431 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 		 1451 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  37.17 
 
 		 1448 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  40.66 
 
 		 1515 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.8 
 
 		 1448 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  33.23 
 
 		 1544 aa  376  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 		 1508 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.68 
 
 		 1505 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  32.81 
 
 		 1480 aa  373  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.64 
 
 		 1412 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 1523 aa  363  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.55 
 
 		 900 aa  361  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  33.09 
 
 		 1572 aa  360  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.4 
 
 		 1626 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  39.21 
 
 		 1599 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  39.23 
 
 		 1598 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.47 
 
 		 1613 aa  357  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.21 
 
 		 1598 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  39.21 
 
 		 1598 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.21 
 
 		 1598 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.21 
 
 		 1598 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.21 
 
 		 1700 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 		 1516 aa  355  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 1514 aa  351  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.45 
 
 		 1523 aa  351  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 1523 aa  351  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.26 
 
 		 1476 aa  350  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.57 
 
 		 1517 aa  346  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.42 
 
 		 1538 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  32.47 
 
 		 1567 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  32.12 
 
 		 1584 aa  338  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.16 
 
 		 1538 aa  337  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.47 
 
 		 1493 aa  337  7.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  31.32 
 
 		 1538 aa  333  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  31.32 
 
 		 1538 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1538 aa  333  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.41 
 
 		 1381 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.32 
 
 		 1538 aa  333  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.03 
 
 		 1538 aa  333  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.38 
 
 		 1525 aa  331  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.63 
 
 		 1513 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  29.37 
 
 		 1379 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  32.98 
 
 		 1549 aa  326  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.34 
 
 		 1694 aa  325  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 		 1534 aa  325  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  29.44 
 
 		 1729 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  31.5 
 
 		 1601 aa  325  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  31.06 
 
 		 1523 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  30.68 
 
 		 1506 aa  323  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.84 
 
 		 1535 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  31.67 
 
 		 1531 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  30.96 
 
 		 1618 aa  318  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  33.99 
 
 		 1536 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  32.87 
 
 		 1509 aa  316  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  34.21 
 
 		 1536 aa  314  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  33.88 
 
 		 1536 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  31.53 
 
 		 1649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.42 
 
 		 1502 aa  310  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  30.49 
 
 		 1495 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 1553 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  31.59 
 
 		 943 aa  308  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.24 
 
 		 1539 aa  307  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.47 
 
 		 1561 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  30.56 
 
 		 1741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  31.54 
 
 		 1632 aa  303  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  28.88 
 
 		 955 aa  299  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  31.32 
 
 		 939 aa  295  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.78 
 
 		 970 aa  294  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.62 
 
 		 946 aa  290  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.16 
 
 		 937 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  35.19 
 
 		 1620 aa  286  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.51 
 
 		 944 aa  282  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>