More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1039 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.7 
 
 		 870 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.16 
 
 		 833 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.03 
 
 		 816 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  43.31 
 
 		 836 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.36 
 
 		 830 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45.3 
 
 		 898 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  42.17 
 
 		 881 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43 
 
 		 817 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  45.35 
 
 		 869 aa  738    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  43.54 
 
 		 829 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 824 aa  1700    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  81.63 
 
 		 831 aa  1394    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  49.51 
 
 		 828 aa  841    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  43.14 
 
 		 823 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.3 
 
 		 819 aa  690    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.53 
 
 		 816 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.22 
 
 		 844 aa  744    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  41.99 
 
 		 882 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  43.17 
 
 		 833 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  43.31 
 
 		 813 aa  686    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  42.82 
 
 		 820 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.87 
 
 		 820 aa  683    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.31 
 
 		 828 aa  848    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.12 
 
 		 828 aa  852    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.92 
 
 		 825 aa  850    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  44.13 
 
 		 825 aa  689    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.91 
 
 		 816 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  42.75 
 
 		 952 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.77 
 
 		 888 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.92 
 
 		 970 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  40.81 
 
 		 970 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 		 966 aa  618  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  43.61 
 
 		 819 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.81 
 
 		 1014 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  39.16 
 
 		 840 aa  602  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.11 
 
 		 809 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.97 
 
 		 801 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 		 849 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.53 
 
 		 851 aa  415  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  33.21 
 
 		 835 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  32.23 
 
 		 904 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 836 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  32.51 
 
 		 846 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  32.14 
 
 		 836 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.72 
 
 		 846 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  33.05 
 
 		 839 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  33.17 
 
 		 853 aa  406  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  33.86 
 
 		 841 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.22 
 
 		 851 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 884 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.59 
 
 		 806 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  32.05 
 
 		 834 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.57 
 
 		 847 aa  399  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  32.92 
 
 		 807 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  33.59 
 
 		 905 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  33.21 
 
 		 835 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  32.95 
 
 		 804 aa  386  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  31.42 
 
 		 853 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  33.65 
 
 		 951 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 851 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  33.25 
 
 		 908 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 		 824 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  31.7 
 
 		 807 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  32.74 
 
 		 937 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  33.67 
 
 		 890 aa  379  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 811 aa  379  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  29.36 
 
 		 868 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  34.05 
 
 		 799 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.27 
 
 		 930 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.8 
 
 		 799 aa  360  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.46 
 
 		 799 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 		 900 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  29.13 
 
 		 888 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.72 
 
 		 1688 aa  299  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.19 
 
 		 872 aa  292  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.92 
 
 		 870 aa  290  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.47 
 
 		 874 aa  282  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.97 
 
 		 874 aa  280  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.62 
 
 		 874 aa  279  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.05 
 
 		 851 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  26.91 
 
 		 915 aa  273  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  27.13 
 
 		 875 aa  269  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  28.34 
 
 		 872 aa  265  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  28.89 
 
 		 1480 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.42 
 
 		 922 aa  256  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  27.24 
 
 		 914 aa  254  6e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  26.51 
 
 		 941 aa  252  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  26.38 
 
 		 873 aa  251  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.26 
 
 		 1538 aa  239  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 928 aa  239  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 1476 aa  239  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.81 
 
 		 926 aa  236  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 928 aa  233  9e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 1534 aa  233  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.92 
 
 		 1538 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.92 
 
 		 1525 aa  232  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 916 aa  231  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.03 
 
 		 1538 aa  231  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.92 
 
 		 1538 aa  231  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  26.92 
 
 		 1538 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>