More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3312 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.92 
 
 		 836 aa  767    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.22 
 
 		 824 aa  788    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  50.88 
 
 		 807 aa  770    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.57 
 
 		 851 aa  793    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  51.04 
 
 		 836 aa  771    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.54 
 
 		 884 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  52.5 
 
 		 835 aa  772    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  52.02 
 
 		 951 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  51.75 
 
 		 799 aa  759    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  51.96 
 
 		 853 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  49.87 
 
 		 937 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 804 aa  1616    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  48.75 
 
 		 807 aa  748    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  51.39 
 
 		 905 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.02 
 
 		 809 aa  799    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  51.66 
 
 		 834 aa  783    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  50.24 
 
 		 904 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  50.48 
 
 		 853 aa  771    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.35 
 
 		 851 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  67.12 
 
 		 806 aa  1075    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  52.61 
 
 		 839 aa  826    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.99 
 
 		 849 aa  835    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  51.69 
 
 		 835 aa  789    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.5 
 
 		 801 aa  1089    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.72 
 
 		 851 aa  807    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  53.61 
 
 		 846 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.65 
 
 		 811 aa  727    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.39 
 
 		 846 aa  806    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  48.71 
 
 		 908 aa  773    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.07 
 
 		 799 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.69 
 
 		 851 aa  794    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  44.56 
 
 		 868 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  51.26 
 
 		 841 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.82 
 
 		 930 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.5 
 
 		 799 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 		 847 aa  745    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  52 
 
 		 890 aa  780    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.56 
 
 		 833 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.78 
 
 		 844 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  37.73 
 
 		 869 aa  453  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  37.15 
 
 		 952 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 		 870 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  36.77 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 819 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  37.68 
 
 		 825 aa  422  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  38.16 
 
 		 833 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  33.33 
 
 		 820 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  36.8 
 
 		 882 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  37.24 
 
 		 881 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.11 
 
 		 898 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.94 
 
 		 817 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.73 
 
 		 816 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.07 
 
 		 830 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  31.17 
 
 		 813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.85 
 
 		 816 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  37.53 
 
 		 819 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.2 
 
 		 828 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.12 
 
 		 828 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.44 
 
 		 816 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  35.57 
 
 		 836 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  31.52 
 
 		 823 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  30.86 
 
 		 828 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 825 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.27 
 
 		 888 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.12 
 
 		 820 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  32.95 
 
 		 824 aa  386  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  32.84 
 
 		 831 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.04 
 
 		 970 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.7 
 
 		 966 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  35.81 
 
 		 970 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  30.36 
 
 		 840 aa  360  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.79 
 
 		 1014 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 		 900 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  29.28 
 
 		 1688 aa  300  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.15 
 
 		 888 aa  297  6e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  28.82 
 
 		 922 aa  271  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  26.09 
 
 		 875 aa  270  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  28.93 
 
 		 915 aa  267  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  26.41 
 
 		 873 aa  266  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.77 
 
 		 1517 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  30.2 
 
 		 870 aa  261  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.05 
 
 		 946 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.13 
 
 		 1508 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.13 
 
 		 1505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.06 
 
 		 1513 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.9 
 
 		 1480 aa  253  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  28.71 
 
 		 914 aa  252  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.26 
 
 		 1429 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.94 
 
 		 1518 aa  251  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.45 
 
 		 1497 aa  251  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  25.98 
 
 		 872 aa  250  7e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.57 
 
 		 1495 aa  250  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 		 1514 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  36.94 
 
 		 1515 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  31.65 
 
 		 943 aa  248  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.4 
 
 		 916 aa  248  3e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  28.93 
 
 		 941 aa  248  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 		 1476 aa  247  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 		 1426 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.52 
 
 		 915 aa  247  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>