More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3147 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 900 aa  1813    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  37.56 
 
 		 888 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  34.08 
 
 		 875 aa  505  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  34.22 
 
 		 1688 aa  483  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  33.22 
 
 		 873 aa  477  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  30.51 
 
 		 874 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  30.79 
 
 		 874 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  33.68 
 
 		 922 aa  398  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.78 
 
 		 874 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.26 
 
 		 872 aa  395  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  33.37 
 
 		 915 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.48 
 
 		 870 aa  382  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  32.52 
 
 		 914 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  33.01 
 
 		 872 aa  376  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  33.22 
 
 		 839 aa  373  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 		 932 aa  366  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 817 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  32.55 
 
 		 941 aa  361  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  31.49 
 
 		 881 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 		 833 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 		 851 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  31.42 
 
 		 829 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 		 816 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  32.15 
 
 		 882 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 		 1426 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 849 aa  357  5.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.91 
 
 		 898 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.42 
 
 		 888 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  31.61 
 
 		 1434 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.06 
 
 		 1429 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.88 
 
 		 816 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  31.77 
 
 		 1504 aa  353  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  31.9 
 
 		 951 aa  353  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.95 
 
 		 1451 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.71 
 
 		 1510 aa  352  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  28.41 
 
 		 813 aa  352  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 		 824 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  31.67 
 
 		 1431 aa  349  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.16 
 
 		 830 aa  347  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  30.69 
 
 		 831 aa  347  5e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  31.33 
 
 		 835 aa  346  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 1508 aa  346  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  30.95 
 
 		 904 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  31.92 
 
 		 1448 aa  344  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  32.1 
 
 		 905 aa  343  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.94 
 
 		 966 aa  343  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  32.32 
 
 		 1480 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 		 870 aa  342  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.57 
 
 		 884 aa  341  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.34 
 
 		 1505 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 844 aa  340  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.94 
 
 		 819 aa  340  8e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.39 
 
 		 1497 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  31.81 
 
 		 853 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.25 
 
 		 801 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 		 1480 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  31.82 
 
 		 825 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  31.9 
 
 		 807 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.7 
 
 		 1518 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  29.84 
 
 		 836 aa  337  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.96 
 
 		 1475 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  31.54 
 
 		 952 aa  337  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  30.43 
 
 		 1573 aa  337  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  31.1 
 
 		 824 aa  336  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  31.85 
 
 		 841 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  31.67 
 
 		 1448 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  30.26 
 
 		 869 aa  335  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.57 
 
 		 816 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.03 
 
 		 1435 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  30.18 
 
 		 1523 aa  333  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  28.93 
 
 		 823 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  31.08 
 
 		 853 aa  331  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.77 
 
 		 851 aa  331  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  32.08 
 
 		 833 aa  329  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.52 
 
 		 847 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  28.97 
 
 		 868 aa  329  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.21 
 
 		 846 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  31.06 
 
 		 908 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  31.23 
 
 		 836 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.23 
 
 		 836 aa  327  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 		 809 aa  326  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  30.99 
 
 		 834 aa  326  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  32.28 
 
 		 890 aa  325  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  31.42 
 
 		 835 aa  323  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  27.99 
 
 		 820 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  31.54 
 
 		 937 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 851 aa  321  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  31.81 
 
 		 804 aa  321  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  29.63 
 
 		 807 aa  320  7.999999999999999e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.72 
 
 		 811 aa  319  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.83 
 
 		 1495 aa  317  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  31.35 
 
 		 846 aa  317  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 1517 aa  317  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.5 
 
 		 1014 aa  314  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 970 aa  313  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  30.11 
 
 		 970 aa  312  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 928 aa  311  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 928 aa  312  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.22 
 
 		 806 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 825 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>