More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0658 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.23 
 
 
846 aa  772    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  95.49 
 
 
799 aa  1489    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.7 
 
 
930 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.22 
 
 
851 aa  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  51.77 
 
 
890 aa  753    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.4 
 
 
851 aa  740    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  51.57 
 
 
835 aa  726    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.47 
 
 
884 aa  768    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  100 
 
 
799 aa  1597    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  53.95 
 
 
846 aa  782    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  46.62 
 
 
937 aa  719    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  51.8 
 
 
804 aa  760    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  70.57 
 
 
807 aa  1156    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  50.7 
 
 
905 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.87 
 
 
809 aa  736    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  50.99 
 
 
904 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  50.73 
 
 
853 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.92 
 
 
806 aa  701    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  50.97 
 
 
839 aa  777    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.22 
 
 
849 aa  786    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  53.77 
 
 
951 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  50 
 
 
835 aa  749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.26 
 
 
851 aa  743    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  52.25 
 
 
834 aa  765    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  49.76 
 
 
853 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.5 
 
 
811 aa  1045    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.69 
 
 
824 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  76.04 
 
 
807 aa  1226    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  51.55 
 
 
908 aa  727    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.18 
 
 
847 aa  721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.87 
 
 
801 aa  762    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  49.46 
 
 
841 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  43.84 
 
 
868 aa  690    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.94 
 
 
836 aa  760    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  51.94 
 
 
836 aa  762    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  99.25 
 
 
799 aa  1586    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 
851 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.48 
 
 
833 aa  415  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  38.37 
 
 
833 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 
844 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  35.16 
 
 
869 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  36.07 
 
 
829 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.74 
 
 
830 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.45 
 
 
898 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  35.77 
 
 
952 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  37.03 
 
 
825 aa  385  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.35 
 
 
817 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.89 
 
 
816 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  36.59 
 
 
836 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  33.91 
 
 
824 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  33.84 
 
 
831 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
828 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.76 
 
 
816 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  29.55 
 
 
828 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.07 
 
 
828 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.66 
 
 
870 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.25 
 
 
970 aa  363  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  37.14 
 
 
819 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  36.01 
 
 
970 aa  360  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 
816 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  35.51 
 
 
882 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  35.31 
 
 
881 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  30.8 
 
 
823 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  30.04 
 
 
813 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.74 
 
 
825 aa  350  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  32.11 
 
 
820 aa  344  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.88 
 
 
819 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.2 
 
 
820 aa  336  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.18 
 
 
966 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.15 
 
 
888 aa  333  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 
1014 aa  324  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  30.21 
 
 
840 aa  317  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.15 
 
 
900 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.88 
 
 
888 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  33.29 
 
 
1480 aa  286  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.66 
 
 
1688 aa  274  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.47 
 
 
1412 aa  272  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  28.59 
 
 
875 aa  265  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.29 
 
 
1480 aa  263  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.94 
 
 
874 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  31.12 
 
 
1531 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.2 
 
 
874 aa  261  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  28.29 
 
 
873 aa  261  4e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.72 
 
 
1505 aa  260  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  38.58 
 
 
1515 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.53 
 
 
1508 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.73 
 
 
1476 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.43 
 
 
874 aa  259  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.52 
 
 
922 aa  258  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.82 
 
 
1518 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.63 
 
 
1626 aa  256  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.02 
 
 
1475 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.14 
 
 
1510 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
1497 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  34.67 
 
 
1448 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  33.59 
 
 
1504 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  32.93 
 
 
1506 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.2 
 
 
1429 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  34.64 
 
 
1431 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  34.83 
 
 
1448 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>