More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0384 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 
1429 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  42.32 
 
 
1538 aa  1109    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  42.32 
 
 
1538 aa  1109    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  53.89 
 
 
1620 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  37.76 
 
 
1741 aa  949    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  34.99 
 
 
1434 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.62 
 
 
1613 aa  1275    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.31 
 
 
1412 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  45.85 
 
 
1668 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.34 
 
 
1525 aa  1105    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  45.3 
 
 
1694 aa  1156    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  58.53 
 
 
1536 aa  1634    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  41.92 
 
 
1538 aa  1097    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  46.63 
 
 
1549 aa  1210    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  48.51 
 
 
1584 aa  1286    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.26 
 
 
1538 aa  1107    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  34.69 
 
 
1431 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.35 
 
 
1451 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  43.3 
 
 
1618 aa  1108    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  42.87 
 
 
1729 aa  1172    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  42.68 
 
 
1577 aa  743    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  46.43 
 
 
1572 aa  1221    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  58.31 
 
 
1536 aa  1630    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  47.56 
 
 
1567 aa  1288    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  49.58 
 
 
1523 aa  1334    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  47.18 
 
 
1632 aa  1196    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  46.79 
 
 
1604 aa  1294    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  41.84 
 
 
1601 aa  1063    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  41.88 
 
 
1538 aa  1102    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  58.8 
 
 
1536 aa  1638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  43.4 
 
 
1660 aa  1084    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.18 
 
 
1538 aa  1108    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.2 
 
 
1510 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.28 
 
 
1502 aa  677    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  47.82 
 
 
1509 aa  1198    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  44.34 
 
 
1649 aa  1132    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
1531 aa  3053    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  34.1 
 
 
1435 aa  678    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  46.56 
 
 
1523 aa  1225    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  42.32 
 
 
1538 aa  1109    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  50.38 
 
 
1606 aa  1196    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  35.82 
 
 
1504 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
1508 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.84 
 
 
1448 aa  713    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.7 
 
 
1426 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
1505 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.68 
 
 
1694 aa  1169    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  46.54 
 
 
1644 aa  1234    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.54 
 
 
1517 aa  1181    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.11 
 
 
1534 aa  868    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  46.89 
 
 
1513 aa  1198    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  48.98 
 
 
1480 aa  1291    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.3 
 
 
1539 aa  1245    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.04 
 
 
1480 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  36.8 
 
 
1448 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.2 
 
 
1516 aa  1316    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  47.74 
 
 
1493 aa  1188    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  48.36 
 
 
1535 aa  1234    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.56 
 
 
1523 aa  1225    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.78 
 
 
1514 aa  1224    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.36 
 
 
1476 aa  1310    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  47.08 
 
 
1506 aa  1241    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  45.35 
 
 
1544 aa  1229    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.62 
 
 
1561 aa  1246    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.03 
 
 
1553 aa  1725    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  43.64 
 
 
1534 aa  1118    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.03 
 
 
1497 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.79 
 
 
1523 aa  1227    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  35.45 
 
 
1388 aa  636  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  40.39 
 
 
1495 aa  612  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  35.65 
 
 
1573 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.23 
 
 
1381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  33.15 
 
 
1379 aa  568  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.41 
 
 
1475 aa  503  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  38.22 
 
 
1419 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  33.9 
 
 
1688 aa  469  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.11 
 
 
1626 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  42.35 
 
 
1598 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.35 
 
 
1700 aa  433  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  42.18 
 
 
1599 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.18 
 
 
1598 aa  430  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  41.43 
 
 
1515 aa  429  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  42.18 
 
 
1598 aa  430  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.18 
 
 
1598 aa  430  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.18 
 
 
1598 aa  430  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.27 
 
 
1518 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  33.52 
 
 
888 aa  411  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.28 
 
 
875 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  33.22 
 
 
873 aa  396  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.52 
 
 
870 aa  379  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  30.15 
 
 
874 aa  360  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  30.21 
 
 
874 aa  358  5e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  30.26 
 
 
874 aa  357  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.68 
 
 
872 aa  350  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  30.9 
 
 
872 aa  349  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.4 
 
 
922 aa  334  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  30.3 
 
 
914 aa  327  8.000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.05 
 
 
915 aa  326  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  31.84 
 
 
941 aa  320  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  29.71 
 
 
1523 aa  310  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>