More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1024 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  57.48 
 
 		 869 aa  968    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.49 
 
 		 888 aa  850    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.4 
 
 		 817 aa  842    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.5 
 
 		 816 aa  842    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  54.62 
 
 		 836 aa  841    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.46 
 
 		 816 aa  835    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  55.01 
 
 		 830 aa  845    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  55.78 
 
 		 898 aa  855    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.8 
 
 		 870 aa  862    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  54.89 
 
 		 829 aa  852    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  46.16 
 
 		 824 aa  747    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  47.09 
 
 		 831 aa  740    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  39.52 
 
 		 828 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  49.28 
 
 		 819 aa  694    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.5 
 
 		 819 aa  781    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  54.88 
 
 		 952 aa  837    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  56.54 
 
 		 881 aa  880    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  84.39 
 
 		 844 aa  1404    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  55.77 
 
 		 882 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  53.81 
 
 		 970 aa  796    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  48.85 
 
 		 820 aa  821    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  48.38 
 
 		 813 aa  837    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.93 
 
 		 820 aa  778    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  48.72 
 
 		 823 aa  814    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 833 aa  1656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  44.62 
 
 		 840 aa  748    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.38 
 
 		 1014 aa  805    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.58 
 
 		 970 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.11 
 
 		 966 aa  818    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.59 
 
 		 828 aa  657    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 825 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  56.09 
 
 		 825 aa  862    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.02 
 
 		 816 aa  835    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  51.67 
 
 		 833 aa  755    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 		 828 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.02 
 
 		 801 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  38.92 
 
 		 804 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  37.97 
 
 		 904 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  38.42 
 
 		 853 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.19 
 
 		 849 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  37.42 
 
 		 835 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  38.91 
 
 		 835 aa  466  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.35 
 
 		 806 aa  465  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.42 
 
 		 824 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.81 
 
 		 884 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  37.49 
 
 		 846 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  37.76 
 
 		 834 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.51 
 
 		 846 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  38.62 
 
 		 905 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  38.43 
 
 		 908 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.59 
 
 		 836 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  37.47 
 
 		 836 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  38.54 
 
 		 951 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.92 
 
 		 851 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  37.21 
 
 		 937 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  36.24 
 
 		 839 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.57 
 
 		 851 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  36.57 
 
 		 853 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.8 
 
 		 851 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.42 
 
 		 809 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  36.32 
 
 		 841 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  38.03 
 
 		 890 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  36.14 
 
 		 807 aa  426  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  37.61 
 
 		 799 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  37.38 
 
 		 807 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.17 
 
 		 847 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  32.55 
 
 		 868 aa  416  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.07 
 
 		 799 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.7 
 
 		 811 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.92 
 
 		 799 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.66 
 
 		 930 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 		 900 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.11 
 
 		 851 aa  314  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  28.75 
 
 		 888 aa  295  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.08 
 
 		 874 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  26.65 
 
 		 872 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  27.57 
 
 		 874 aa  282  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.45 
 
 		 874 aa  280  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  26.84 
 
 		 1688 aa  277  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.62 
 
 		 873 aa  271  5e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.07 
 
 		 915 aa  267  7e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  25.15 
 
 		 875 aa  261  4e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  28.44 
 
 		 922 aa  261  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  28.49 
 
 		 914 aa  260  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.4 
 
 		 870 aa  256  9e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  27.87 
 
 		 941 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  28.36 
 
 		 872 aa  238  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 927 aa  228  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 		 928 aa  228  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.71 
 
 		 890 aa  228  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28 
 
 		 916 aa  228  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.28 
 
 		 937 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  28.29 
 
 		 1480 aa  224  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 		 1517 aa  224  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 970 aa  224  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 		 1381 aa  224  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  27.64 
 
 		 1379 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  30.06 
 
 		 1388 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 1475 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 1518 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>