More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1879 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.76 
 
 		 937 aa  862    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 970 aa  1957    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.01 
 
 		 928 aa  900    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.62 
 
 		 927 aa  865    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.72 
 
 		 928 aa  863    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  39.82 
 
 		 955 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.04 
 
 		 932 aa  611  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  35.82 
 
 		 939 aa  592  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  36.4 
 
 		 943 aa  590  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  36 
 
 		 954 aa  588  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.83 
 
 		 944 aa  579  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.1 
 
 		 972 aa  580  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  35.41 
 
 		 946 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.8 
 
 		 909 aa  520  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.57 
 
 		 897 aa  522  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  34.48 
 
 		 903 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.49 
 
 		 926 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.45 
 
 		 916 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.3 
 
 		 890 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  34.27 
 
 		 898 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 		 903 aa  500  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.1 
 
 		 916 aa  496  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.4 
 
 		 915 aa  491  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 		 912 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 		 913 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.64 
 
 		 905 aa  411  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.85 
 
 		 913 aa  411  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 		 946 aa  394  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.07 
 
 		 1688 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  30.91 
 
 		 873 aa  361  4e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.51 
 
 		 888 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  30.66 
 
 		 875 aa  346  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  31.07 
 
 		 870 aa  344  5e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.4 
 
 		 872 aa  335  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.16 
 
 		 1480 aa  322  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.18 
 
 		 1412 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.32 
 
 		 915 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  30.24 
 
 		 1388 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  28.64 
 
 		 914 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  29.56 
 
 		 1435 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.02 
 
 		 933 aa  303  9e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  30.19 
 
 		 1506 aa  303  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.39 
 
 		 1534 aa  303  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  28.84 
 
 		 1431 aa  300  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 		 1429 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.12 
 
 		 1502 aa  297  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  30.7 
 
 		 1419 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  28 
 
 		 1448 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  29.78 
 
 		 941 aa  294  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 1475 aa  294  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.76 
 
 		 931 aa  293  8e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  28.95 
 
 		 1434 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  29.01 
 
 		 1584 aa  292  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 1497 aa  292  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.94 
 
 		 922 aa  292  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 1426 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  31.03 
 
 		 1448 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 		 1476 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.59 
 
 		 1553 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.28 
 
 		 874 aa  288  5e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  29.16 
 
 		 1544 aa  286  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28 
 
 		 874 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.23 
 
 		 874 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 		 1451 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  28.72 
 
 		 1531 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  29.75 
 
 		 1536 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  29.41 
 
 		 1549 aa  282  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  30.05 
 
 		 1504 aa  283  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.49 
 
 		 1510 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 900 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  27.96 
 
 		 1534 aa  280  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  29.64 
 
 		 1536 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  29.66 
 
 		 1536 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  29.78 
 
 		 1535 aa  279  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  30.12 
 
 		 1509 aa  278  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  30.42 
 
 		 1493 aa  278  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1480 aa  277  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28 
 
 		 872 aa  277  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.81 
 
 		 1514 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.44 
 
 		 1523 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  26.74 
 
 		 1573 aa  275  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  30.97 
 
 		 1632 aa  274  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.09 
 
 		 1505 aa  274  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1517 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.42 
 
 		 1508 aa  273  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  28.67 
 
 		 1495 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.66 
 
 		 1518 aa  271  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.54 
 
 		 1538 aa  270  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.14 
 
 		 1523 aa  270  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 1523 aa  270  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  27.73 
 
 		 1523 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  28.54 
 
 		 1538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  28.54 
 
 		 1538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.54 
 
 		 1538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.27 
 
 		 1525 aa  267  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  27.7 
 
 		 1620 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.54 
 
 		 1538 aa  266  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.09 
 
 		 1538 aa  265  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  28.3 
 
 		 1572 aa  263  8e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>