More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0307 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 
970 aa  1904    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.7 
 
 
833 aa  819    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.47 
 
 
816 aa  955    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  59.82 
 
 
836 aa  973    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.54 
 
 
888 aa  908    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.95 
 
 
870 aa  950    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  60.11 
 
 
830 aa  979    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.08 
 
 
844 aa  811    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  60.54 
 
 
898 aa  1027    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  42.03 
 
 
820 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.47 
 
 
816 aa  951    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.66 
 
 
819 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  59.66 
 
 
829 aa  986    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  48.27 
 
 
833 aa  680    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  41.16 
 
 
824 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.67 
 
 
966 aa  1352    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  41.43 
 
 
823 aa  684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  39.28 
 
 
840 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  57.66 
 
 
882 aa  935    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  51.86 
 
 
869 aa  832    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.66 
 
 
816 aa  941    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  42.2 
 
 
813 aa  713    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.66 
 
 
820 aa  682    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.54 
 
 
817 aa  966    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  57.72 
 
 
881 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  69.4 
 
 
952 aa  1115    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.11 
 
 
1014 aa  1350    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  98.14 
 
 
970 aa  1862    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  60.55 
 
 
825 aa  957    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  41.45 
 
 
831 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  46 
 
 
819 aa  609  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.52 
 
 
828 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.52 
 
 
828 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  35.29 
 
 
828 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.59 
 
 
825 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  34.09 
 
 
835 aa  413  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.13 
 
 
824 aa  406  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.02 
 
 
851 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.36 
 
 
846 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  35.25 
 
 
846 aa  399  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  35.81 
 
 
804 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.72 
 
 
849 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
851 aa  396  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  34.43 
 
 
834 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  33.41 
 
 
853 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.28 
 
 
836 aa  389  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.23 
 
 
809 aa  389  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  33.03 
 
 
841 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.32 
 
 
806 aa  389  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  34.17 
 
 
836 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  34.71 
 
 
807 aa  389  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  32.91 
 
 
839 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.08 
 
 
847 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  36.01 
 
 
799 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.13 
 
 
851 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  32.82 
 
 
904 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  32.87 
 
 
908 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.67 
 
 
884 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  33.15 
 
 
807 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.89 
 
 
811 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  30.46 
 
 
868 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.66 
 
 
799 aa  364  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  33.55 
 
 
951 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.99 
 
 
799 aa  363  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  32.34 
 
 
905 aa  363  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  31.94 
 
 
937 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  32.76 
 
 
853 aa  357  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  33.45 
 
 
890 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  33.94 
 
 
835 aa  354  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.73 
 
 
930 aa  346  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.85 
 
 
900 aa  328  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.29 
 
 
851 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  28.12 
 
 
888 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  25.32 
 
 
873 aa  254  7e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  24.39 
 
 
875 aa  253  9.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.37 
 
 
1688 aa  253  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  24.09 
 
 
872 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  24.14 
 
 
874 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.58 
 
 
922 aa  237  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  24.36 
 
 
874 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  27.55 
 
 
872 aa  230  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  25.06 
 
 
874 aa  230  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.31 
 
 
1480 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.27 
 
 
915 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  28.07 
 
 
941 aa  224  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  26.44 
 
 
870 aa  220  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  26.33 
 
 
914 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 
932 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.68 
 
 
916 aa  214  7e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.51 
 
 
1523 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.51 
 
 
1523 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.34 
 
 
1598 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  34.34 
 
 
1598 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.34 
 
 
1700 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.79 
 
 
1626 aa  213  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.4 
 
 
1523 aa  213  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 
1518 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.34 
 
 
1598 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.34 
 
 
1598 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>