More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2425 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
698 aa  1395    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.62 
 
 
716 aa  617  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  41.31 
 
 
710 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.8 
 
 
701 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  35.24 
 
 
925 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 
706 aa  316  8e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  34.44 
 
 
925 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.01 
 
 
711 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
675 aa  291  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.98 
 
 
696 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.35 
 
 
711 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  33.54 
 
 
694 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.21 
 
 
694 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.74 
 
 
708 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  33.48 
 
 
702 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.72 
 
 
716 aa  257  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.33 
 
 
710 aa  253  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.8 
 
 
741 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.78 
 
 
711 aa  235  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.64 
 
 
931 aa  234  6e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
932 aa  230  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  30.22 
 
 
740 aa  230  7e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.06 
 
 
933 aa  229  9e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  32.46 
 
 
722 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.96 
 
 
970 aa  229  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 
928 aa  224  4e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  31.82 
 
 
753 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  31.44 
 
 
943 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.84 
 
 
927 aa  221  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  30.08 
 
 
939 aa  220  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.23 
 
 
744 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.23 
 
 
909 aa  217  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.04 
 
 
755 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  30.82 
 
 
955 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.71 
 
 
928 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.08 
 
 
937 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.39 
 
 
890 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.44 
 
 
696 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 
916 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  39.52 
 
 
898 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.41 
 
 
736 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.96 
 
 
916 aa  213  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.92 
 
 
725 aa  211  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  29.3 
 
 
740 aa  211  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.26 
 
 
905 aa  209  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  31.01 
 
 
736 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 
915 aa  206  9e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 
738 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.07 
 
 
913 aa  205  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.19 
 
 
897 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.69 
 
 
734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.92 
 
 
743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  30.62 
 
 
903 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.12 
 
 
972 aa  201  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
903 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 
946 aa  196  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
1426 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.82 
 
 
1434 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  31.47 
 
 
1504 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  29.77 
 
 
954 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
926 aa  194  4e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  30.35 
 
 
946 aa  194  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  30.48 
 
 
746 aa  194  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.97 
 
 
1429 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.81 
 
 
944 aa  193  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  30.58 
 
 
1431 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  30.78 
 
 
751 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 
912 aa  192  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.16 
 
 
1497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  30.86 
 
 
1573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 
1451 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  29.62 
 
 
743 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.19 
 
 
1508 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  29.67 
 
 
799 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  31.24 
 
 
723 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.41 
 
 
739 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.33 
 
 
1510 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.32 
 
 
1505 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.73 
 
 
1412 aa  187  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.16 
 
 
1688 aa  187  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 
1514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  30.68 
 
 
1515 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.57 
 
 
740 aa  185  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  27.87 
 
 
807 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
1518 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.96 
 
 
1517 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  29.39 
 
 
1599 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  29.39 
 
 
1598 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.39 
 
 
1700 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.57 
 
 
1626 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 
1480 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.39 
 
 
1598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  30.43 
 
 
1448 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  29.39 
 
 
1598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.39 
 
 
1598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.39 
 
 
1598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  31 
 
 
1480 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.05 
 
 
799 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  30.06 
 
 
1448 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.82 
 
 
783 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>