More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1238 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.59 
 
 		 706 aa  765    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.26 
 
 		 701 aa  817    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  99.14 
 
 		 925 aa  1840    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 925 aa  1854    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.83 
 
 		 711 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.55 
 
 		 696 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.92 
 
 		 711 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.77 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.34 
 
 		 675 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  38.1 
 
 		 694 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  38.04 
 
 		 702 aa  363  6e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.06 
 
 		 716 aa  344  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  38.33 
 
 		 753 aa  334  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 698 aa  330  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  37.39 
 
 		 710 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.9 
 
 		 711 aa  293  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  31.73 
 
 		 722 aa  279  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.33 
 
 		 708 aa  277  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  31.04 
 
 		 740 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.21 
 
 		 738 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.48 
 
 		 725 aa  272  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  30.82 
 
 		 736 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.58 
 
 		 710 aa  270  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 		 931 aa  266  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.04 
 
 		 734 aa  264  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.99 
 
 		 744 aa  264  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  31.96 
 
 		 740 aa  264  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 903 aa  264  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  31.32 
 
 		 723 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.92 
 
 		 716 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.92 
 
 		 743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.78 
 
 		 736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  31.4 
 
 		 898 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.04 
 
 		 897 aa  254  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  30.65 
 
 		 955 aa  252  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 937 aa  252  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 		 927 aa  252  3e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.42 
 
 		 741 aa  250  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.77 
 
 		 932 aa  250  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 928 aa  246  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  31.54 
 
 		 743 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 739 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  30.41 
 
 		 734 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.63 
 
 		 755 aa  244  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.85 
 
 		 783 aa  243  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 928 aa  243  9e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 		 909 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 		 916 aa  241  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.74 
 
 		 890 aa  238  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  31.75 
 
 		 939 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  30.91 
 
 		 751 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  30.9 
 
 		 943 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  29.05 
 
 		 746 aa  234  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.44 
 
 		 970 aa  233  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.13 
 
 		 916 aa  231  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 		 740 aa  230  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 		 933 aa  230  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.99 
 
 		 972 aa  229  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.27 
 
 		 946 aa  229  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  30.02 
 
 		 903 aa  229  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 		 912 aa  226  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.18 
 
 		 696 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  30.16 
 
 		 954 aa  221  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.39 
 
 		 944 aa  220  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.9 
 
 		 913 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.7 
 
 		 915 aa  212  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.6 
 
 		 926 aa  211  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.63 
 
 		 1412 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 		 905 aa  205  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.98 
 
 		 1688 aa  203  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 		 801 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.47 
 
 		 913 aa  193  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.03 
 
 		 854 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.04 
 
 		 1480 aa  188  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  28.8 
 
 		 873 aa  183  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 946 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 		 824 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  27.41 
 
 		 888 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  29.9 
 
 		 807 aa  181  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.26 
 
 		 874 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.93 
 
 		 874 aa  180  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  27.26 
 
 		 874 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 1381 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  34.43 
 
 		 799 aa  178  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  29.26 
 
 		 1567 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  28.77 
 
 		 1379 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  31.62 
 
 		 807 aa  174  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  29.13 
 
 		 1515 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  28.86 
 
 		 1535 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.39 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  28.93 
 
 		 1495 aa  173  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.84 
 
 		 1508 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.23 
 
 		 1480 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.12 
 
 		 870 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 		 799 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1505 aa  172  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.75 
 
 		 1518 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  26.8 
 
 		 875 aa  171  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  28.12 
 
 		 1584 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>