More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1220 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
696 aa  1414    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.36 
 
 
716 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.8 
 
 
710 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.13 
 
 
708 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.64 
 
 
711 aa  350  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  31.78 
 
 
722 aa  293  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  32.43 
 
 
736 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  31.99 
 
 
740 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 
738 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.66 
 
 
744 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  33.11 
 
 
723 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.61 
 
 
741 aa  283  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 
743 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 
734 aa  281  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  29.41 
 
 
740 aa  280  7e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.93 
 
 
736 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  31.12 
 
 
751 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.43 
 
 
755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  32.38 
 
 
734 aa  275  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  32.41 
 
 
743 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.21 
 
 
725 aa  273  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.87 
 
 
739 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 
740 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  30.61 
 
 
746 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.83 
 
 
783 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.83 
 
 
696 aa  234  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.08 
 
 
701 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.43 
 
 
694 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.84 
 
 
711 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  25.18 
 
 
925 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.42 
 
 
716 aa  217  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.19 
 
 
706 aa  216  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  25.18 
 
 
925 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.44 
 
 
698 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  26.92 
 
 
694 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.71 
 
 
711 aa  210  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
926 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.88 
 
 
675 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.34 
 
 
931 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  31.02 
 
 
898 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  29.43 
 
 
702 aa  195  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.73 
 
 
909 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  26.47 
 
 
753 aa  193  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.38 
 
 
933 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  26.6 
 
 
710 aa  186  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.91 
 
 
916 aa  182  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.44 
 
 
905 aa  181  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
913 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.34 
 
 
903 aa  177  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.22 
 
 
916 aa  177  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.32 
 
 
897 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.18 
 
 
932 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  27.02 
 
 
939 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
937 aa  171  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.29 
 
 
944 aa  171  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.16 
 
 
928 aa  171  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.29 
 
 
913 aa  169  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.22 
 
 
927 aa  169  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  28.09 
 
 
903 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 
915 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  31.25 
 
 
955 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  28.28 
 
 
1573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 
970 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.21 
 
 
912 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.98 
 
 
928 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.34 
 
 
854 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26 
 
 
890 aa  163  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  27.89 
 
 
943 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  28.21 
 
 
873 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.98 
 
 
1412 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.42 
 
 
972 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 
946 aa  159  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  25.54 
 
 
954 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.64 
 
 
1476 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.5 
 
 
1534 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  26.48 
 
 
1506 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  25.5 
 
 
1480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  25.38 
 
 
1493 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  27.78 
 
 
1448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.98 
 
 
915 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  27.06 
 
 
1504 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  28.26 
 
 
1431 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  27.78 
 
 
1448 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  25.24 
 
 
1534 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.25 
 
 
1516 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.63 
 
 
1451 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  24.73 
 
 
946 aa  144  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 
1475 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  29.09 
 
 
1435 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  27.51 
 
 
875 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  24.71 
 
 
1584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  24.6 
 
 
1620 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  27.05 
 
 
1688 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  26.26 
 
 
1531 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.96 
 
 
1517 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.18 
 
 
1381 aa  140  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  28.33 
 
 
1388 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.72 
 
 
1510 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.76 
 
 
1508 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.09 
 
 
1502 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>