More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1943 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 933 aa  1885    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.7 
 
 		 931 aa  1069    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 		 928 aa  335  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 		 927 aa  331  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 937 aa  324  4e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.39 
 
 		 928 aa  325  4e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.99 
 
 		 944 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  29.85 
 
 		 898 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.96 
 
 		 909 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  31.98 
 
 		 955 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  26.09 
 
 		 939 aa  308  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.25 
 
 		 932 aa  308  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  28.55 
 
 		 903 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 		 970 aa  303  9e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.9 
 
 		 903 aa  303  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  26.69 
 
 		 943 aa  303  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.02 
 
 		 926 aa  301  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.63 
 
 		 972 aa  297  6e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  31.13 
 
 		 954 aa  296  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  26.28 
 
 		 946 aa  291  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.72 
 
 		 897 aa  289  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.22 
 
 		 916 aa  278  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.68 
 
 		 913 aa  278  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.15 
 
 		 916 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  29.17 
 
 		 888 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.75 
 
 		 915 aa  267  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.35 
 
 		 946 aa  262  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  27.88 
 
 		 1688 aa  261  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 1429 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  28.43 
 
 		 1434 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 1426 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.58 
 
 		 912 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.33 
 
 		 890 aa  252  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.59 
 
 		 1451 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 		 905 aa  248  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.19 
 
 		 854 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.22 
 
 		 716 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.49 
 
 		 913 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  30.76 
 
 		 1448 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  30.42 
 
 		 875 aa  241  5e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  30.76 
 
 		 1448 aa  240  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.86 
 
 		 1435 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  27.52 
 
 		 1480 aa  234  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 1508 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.47 
 
 		 1412 aa  233  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.29 
 
 		 1495 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  27.8 
 
 		 1431 aa  233  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 1505 aa  232  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 698 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.22 
 
 		 1480 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.49 
 
 		 701 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.52 
 
 		 874 aa  227  6e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  27.85 
 
 		 874 aa  227  8e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 1518 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  28.69 
 
 		 1515 aa  225  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.62 
 
 		 711 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  31.15 
 
 		 873 aa  222  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  26.34 
 
 		 1535 aa  222  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  26.17 
 
 		 872 aa  222  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.12 
 
 		 1497 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.07 
 
 		 874 aa  221  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  28.61 
 
 		 1531 aa  221  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.65 
 
 		 1510 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  29.98 
 
 		 1573 aa  220  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  28.94 
 
 		 1388 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  29.41 
 
 		 925 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.95 
 
 		 694 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.95 
 
 		 1626 aa  219  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  26.94 
 
 		 870 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.96 
 
 		 706 aa  218  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  29.41 
 
 		 925 aa  217  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  29.59 
 
 		 1598 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.77 
 
 		 1700 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.82 
 
 		 1476 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  24.15 
 
 		 1536 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  28.43 
 
 		 1584 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  24.42 
 
 		 1536 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  29.23 
 
 		 1599 aa  214  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 		 1475 aa  214  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.23 
 
 		 1598 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  26.75 
 
 		 1536 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.7 
 
 		 1523 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  26.87 
 
 		 872 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.23 
 
 		 1598 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  29.23 
 
 		 1598 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.23 
 
 		 1598 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  23.96 
 
 		 1523 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.96 
 
 		 1523 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.75 
 
 		 922 aa  213  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  29.02 
 
 		 1504 aa  212  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.78 
 
 		 1539 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  27.95 
 
 		 710 aa  211  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  25.98 
 
 		 915 aa  211  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 696 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 		 675 aa  211  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  29.45 
 
 		 1419 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.9 
 
 		 1502 aa  208  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  26.32 
 
 		 1572 aa  207  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  24.64 
 
 		 1544 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  26.37 
 
 		 1606 aa  206  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>