More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8552 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 783 aa  1551    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  46.47 
 
 		 723 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.22 
 
 		 734 aa  624  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.63 
 
 		 743 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  44.88 
 
 		 736 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.89 
 
 		 744 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 		 738 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  45.56 
 
 		 740 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.86 
 
 		 755 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  45.77 
 
 		 751 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  44.74 
 
 		 743 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.61 
 
 		 740 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  43.22 
 
 		 734 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.47 
 
 		 736 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.68 
 
 		 739 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  43.59 
 
 		 746 aa  512  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.19 
 
 		 725 aa  509  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.59 
 
 		 741 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  31.94 
 
 		 722 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.28 
 
 		 711 aa  364  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  32.76 
 
 		 740 aa  363  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.07 
 
 		 716 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.57 
 
 		 708 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 		 701 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.83 
 
 		 696 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.49 
 
 		 711 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.73 
 
 		 706 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.97 
 
 		 716 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.66 
 
 		 696 aa  210  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.43 
 
 		 711 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.44 
 
 		 710 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.43 
 
 		 694 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  31.48 
 
 		 694 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  28.81 
 
 		 925 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  30.97 
 
 		 702 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  28.81 
 
 		 925 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 698 aa  180  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  28.31 
 
 		 939 aa  177  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.88 
 
 		 970 aa  177  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.41 
 
 		 931 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.67 
 
 		 972 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 932 aa  170  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.68 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  31.35 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  28.72 
 
 		 710 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.41 
 
 		 916 aa  168  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.58 
 
 		 926 aa  167  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 912 aa  167  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 928 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.12 
 
 		 913 aa  167  8e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29 
 
 		 937 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 927 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 916 aa  163  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  26.85 
 
 		 943 aa  161  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.87 
 
 		 928 aa  160  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.66 
 
 		 806 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  27.29 
 
 		 954 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.04 
 
 		 933 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.3 
 
 		 913 aa  153  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  27.66 
 
 		 955 aa  151  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  26.39 
 
 		 946 aa  151  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.19 
 
 		 801 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  31.12 
 
 		 898 aa  145  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 915 aa  144  6e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.3 
 
 		 944 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.57 
 
 		 905 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.2 
 
 		 820 aa  140  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.62 
 
 		 833 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.62 
 
 		 819 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  26.03 
 
 		 1577 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  32.57 
 
 		 807 aa  136  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 946 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  26.14 
 
 		 869 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 799 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.6 
 
 		 799 aa  134  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  28.88 
 
 		 807 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  28.3 
 
 		 799 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.44 
 
 		 1388 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.78 
 
 		 1412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  32.75 
 
 		 853 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  28.59 
 
 		 839 aa  132  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.75 
 
 		 811 aa  131  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  27.75 
 
 		 1506 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  27.34 
 
 		 952 aa  131  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  28.27 
 
 		 1379 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  26.49 
 
 		 834 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 849 aa  130  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 846 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  26.71 
 
 		 836 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 1476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  31.34 
 
 		 841 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  34.11 
 
 		 804 aa  128  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  25.84 
 
 		 1480 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.7 
 
 		 844 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  27.88 
 
 		 846 aa  127  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 824 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  29.08 
 
 		 1618 aa  127  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.11 
 
 		 675 aa  127  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.43 
 
 		 897 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  29.46 
 
 		 904 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>