More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3388 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  47.2 
 
 
955 aa  892    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 
954 aa  1929    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  65.86 
 
 
943 aa  1283    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.65 
 
 
972 aa  1234    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  86.09 
 
 
946 aa  1676    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.75 
 
 
903 aa  711    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  41.31 
 
 
898 aa  714    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  68.31 
 
 
939 aa  1335    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.79 
 
 
944 aa  934    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.02 
 
 
897 aa  719    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.16 
 
 
932 aa  893    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  42.78 
 
 
903 aa  736    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.6 
 
 
909 aa  718    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 
927 aa  619  1e-176  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.85 
 
 
928 aa  618  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.72 
 
 
890 aa  614  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.83 
 
 
928 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
970 aa  601  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.89 
 
 
937 aa  594  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.58 
 
 
926 aa  527  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.92 
 
 
913 aa  521  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.85 
 
 
916 aa  500  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.06 
 
 
916 aa  488  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.47 
 
 
915 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.79 
 
 
905 aa  468  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.83 
 
 
913 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.53 
 
 
946 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.8 
 
 
912 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.69 
 
 
1688 aa  347  5e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.85 
 
 
888 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.44 
 
 
875 aa  335  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  30.96 
 
 
872 aa  323  7e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.95 
 
 
931 aa  315  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.05 
 
 
873 aa  309  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  36.58 
 
 
1480 aa  309  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  30.04 
 
 
870 aa  308  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.06 
 
 
874 aa  301  5e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.22 
 
 
933 aa  299  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.36 
 
 
915 aa  298  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.24 
 
 
874 aa  296  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.74 
 
 
872 aa  296  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.83 
 
 
874 aa  294  6e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  32.4 
 
 
941 aa  290  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.87 
 
 
1435 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.55 
 
 
914 aa  287  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.76 
 
 
900 aa  287  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 
1476 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.19 
 
 
1412 aa  283  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.44 
 
 
922 aa  283  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.87 
 
 
1480 aa  280  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.25 
 
 
1388 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 
1534 aa  279  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.47 
 
 
1553 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  30.72 
 
 
1544 aa  278  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 
1517 aa  276  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  29.36 
 
 
1495 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  31.12 
 
 
1493 aa  276  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.2 
 
 
1429 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.2 
 
 
1426 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.75 
 
 
1505 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  34.47 
 
 
1536 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  30.01 
 
 
1573 aa  270  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  34.48 
 
 
1536 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  28.96 
 
 
1434 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  34.18 
 
 
1536 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
1508 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.53 
 
 
1523 aa  267  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
1523 aa  267  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.25 
 
 
1510 aa  267  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  31.24 
 
 
1535 aa  266  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.89 
 
 
1523 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 
1514 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 
1518 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  35.33 
 
 
1531 aa  266  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.69 
 
 
1502 aa  264  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  34.12 
 
 
1515 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  30.57 
 
 
1504 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  35.15 
 
 
1534 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
1497 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  30.59 
 
 
1632 aa  263  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 
1475 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
1451 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.2 
 
 
1626 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  29.82 
 
 
1431 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.33 
 
 
1513 aa  258  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  35.37 
 
 
1599 aa  257  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  35.2 
 
 
1598 aa  257  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 
1516 aa  257  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  35.37 
 
 
1598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.37 
 
 
1598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.2 
 
 
1700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.37 
 
 
1598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.37 
 
 
1598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  29.93 
 
 
1448 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  30.39 
 
 
1448 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  33.18 
 
 
1620 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  31.04 
 
 
807 aa  252  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  35.07 
 
 
1419 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  30.73 
 
 
1506 aa  250  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  28.94 
 
 
1741 aa  250  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.800534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>