More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2957 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 753 aa  1484    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 		 696 aa  628  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  50.34 
 
 		 711 aa  621  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  51.25 
 
 		 694 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  51.94 
 
 		 702 aa  588  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.17 
 
 		 694 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 		 675 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.8 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.62 
 
 		 706 aa  361  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.78 
 
 		 711 aa  353  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  38.13 
 
 		 925 aa  341  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  38.13 
 
 		 925 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.75 
 
 		 716 aa  270  7e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  34.57 
 
 		 710 aa  270  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 710 aa  260  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 698 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.38 
 
 		 716 aa  235  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  29.97 
 
 		 722 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.82 
 
 		 734 aa  232  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.2 
 
 		 696 aa  229  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.35 
 
 		 708 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  33 
 
 		 740 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.58 
 
 		 711 aa  226  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.2 
 
 		 755 aa  218  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.85 
 
 		 744 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 		 916 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.55 
 
 		 890 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.85 
 
 		 741 aa  214  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  30.51 
 
 		 898 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.38 
 
 		 743 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  32.16 
 
 		 751 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.56 
 
 		 738 aa  210  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  29.41 
 
 		 955 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.38 
 
 		 944 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  30.33 
 
 		 736 aa  207  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  28.32 
 
 		 740 aa  204  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.91 
 
 		 932 aa  204  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 		 739 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  32.73 
 
 		 734 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.89 
 
 		 931 aa  202  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  31.18 
 
 		 943 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.25 
 
 		 928 aa  201  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 909 aa  200  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.03 
 
 		 736 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  32.19 
 
 		 954 aa  198  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.4 
 
 		 725 aa  197  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.58 
 
 		 783 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.64 
 
 		 933 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.66 
 
 		 912 aa  193  8e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  30.97 
 
 		 903 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 905 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  35.66 
 
 		 939 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.49 
 
 		 916 aa  190  7e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 		 928 aa  190  7e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 740 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 903 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 		 915 aa  189  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.85 
 
 		 927 aa  189  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  29.72 
 
 		 743 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  33.42 
 
 		 946 aa  188  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 970 aa  187  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.6 
 
 		 972 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  28.93 
 
 		 723 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 		 946 aa  184  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 854 aa  184  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.64 
 
 		 897 aa  184  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 937 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  28.21 
 
 		 746 aa  181  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 926 aa  180  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.17 
 
 		 913 aa  170  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  34.65 
 
 		 1448 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  33.63 
 
 		 1448 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  34.64 
 
 		 1573 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  36.69 
 
 		 839 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.73 
 
 		 1412 aa  165  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.75 
 
 		 888 aa  165  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  33.56 
 
 		 1493 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1534 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  32.04 
 
 		 1549 aa  162  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.34 
 
 		 913 aa  161  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  36.03 
 
 		 799 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.03 
 
 		 799 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.34 
 
 		 809 aa  160  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.75 
 
 		 799 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.83 
 
 		 1535 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.51 
 
 		 801 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  32.1 
 
 		 1544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  34.25 
 
 		 1513 aa  157  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  31.35 
 
 		 1534 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.83 
 
 		 915 aa  157  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  31.69 
 
 		 941 aa  157  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  30.21 
 
 		 1618 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 		 1523 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.1 
 
 		 874 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.65 
 
 		 1523 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  30.57 
 
 		 1572 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 		 1523 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.92 
 
 		 1538 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.71 
 
 		 1514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.76 
 
 		 1538 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>