More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3426 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.33 
 
 		 744 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  69.93 
 
 		 740 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.5 
 
 		 734 aa  741    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 738 aa  1499    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  58.67 
 
 		 743 aa  845    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.03 
 
 		 740 aa  773    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.14 
 
 		 743 aa  750    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  88.4 
 
 		 736 aa  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  52.35 
 
 		 734 aa  730    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  49.25 
 
 		 723 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.3 
 
 		 736 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.44 
 
 		 783 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.26 
 
 		 755 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  43.32 
 
 		 751 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  44.17 
 
 		 746 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.09 
 
 		 739 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.42 
 
 		 725 aa  525  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.14 
 
 		 741 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  34.94 
 
 		 722 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  35.01 
 
 		 740 aa  416  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 		 710 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.86 
 
 		 711 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.49 
 
 		 716 aa  334  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.7 
 
 		 708 aa  320  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.65 
 
 		 696 aa  288  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  30.12 
 
 		 925 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  30.25 
 
 		 925 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.17 
 
 		 701 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.57 
 
 		 706 aa  251  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.67 
 
 		 711 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.58 
 
 		 711 aa  230  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.83 
 
 		 716 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 913 aa  209  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 		 698 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  28.55 
 
 		 943 aa  206  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 696 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  32.92 
 
 		 710 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.89 
 
 		 675 aa  200  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  28.11 
 
 		 939 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.34 
 
 		 694 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26 
 
 		 933 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 931 aa  195  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  33.39 
 
 		 702 aa  194  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  29.85 
 
 		 694 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 926 aa  191  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.03 
 
 		 972 aa  188  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  27.82 
 
 		 955 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 928 aa  187  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.77 
 
 		 890 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.45 
 
 		 927 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.19 
 
 		 897 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  32.41 
 
 		 898 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 928 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 		 937 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.93 
 
 		 909 aa  183  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.87 
 
 		 913 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  27.36 
 
 		 954 aa  180  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.64 
 
 		 912 aa  179  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.47 
 
 		 916 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.44 
 
 		 944 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  27.46 
 
 		 946 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.67 
 
 		 1688 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.88 
 
 		 916 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.85 
 
 		 970 aa  174  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  30.27 
 
 		 753 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 		 932 aa  173  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 946 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  26.24 
 
 		 903 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  28.57 
 
 		 873 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  31.44 
 
 		 807 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.7 
 
 		 903 aa  160  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.84 
 
 		 905 aa  159  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.69 
 
 		 1412 aa  158  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.81 
 
 		 872 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.91 
 
 		 854 aa  157  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.52 
 
 		 922 aa  157  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.73 
 
 		 915 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  30.85 
 
 		 1379 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.58 
 
 		 833 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.15 
 
 		 1480 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.77 
 
 		 1518 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  27.77 
 
 		 888 aa  154  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  30.23 
 
 		 875 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.57 
 
 		 1510 aa  154  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  28.77 
 
 		 1515 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 824 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 		 915 aa  152  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 1508 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.39 
 
 		 1534 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  29.9 
 
 		 1504 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 1505 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  29.56 
 
 		 1599 aa  152  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.88 
 
 		 1497 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.56 
 
 		 1598 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.13 
 
 		 874 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.56 
 
 		 1598 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.56 
 
 		 1598 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  29.56 
 
 		 1598 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.35 
 
 		 874 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.56 
 
 		 1700 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>