More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2100 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.08 
 
 		 903 aa  1286    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  44.2 
 
 		 955 aa  769    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  43.78 
 
 		 939 aa  730    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.75 
 
 		 972 aa  722    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  43.15 
 
 		 943 aa  733    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  61.69 
 
 		 898 aa  1155    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.42 
 
 		 944 aa  815    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 897 aa  1823    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.92 
 
 		 932 aa  781    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  43.33 
 
 		 946 aa  719    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  43.02 
 
 		 954 aa  704    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  61.41 
 
 		 903 aa  1145    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.09 
 
 		 909 aa  1274    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.39 
 
 		 890 aa  549  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.19 
 
 		 927 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.56 
 
 		 916 aa  537  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.42 
 
 		 928 aa  535  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.17 
 
 		 926 aa  531  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.02 
 
 		 937 aa  527  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.57 
 
 		 970 aa  527  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.55 
 
 		 916 aa  524  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 		 928 aa  505  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.97 
 
 		 912 aa  497  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 913 aa  488  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.34 
 
 		 915 aa  485  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.59 
 
 		 946 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.18 
 
 		 905 aa  462  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.54 
 
 		 913 aa  421  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.08 
 
 		 1688 aa  357  5.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.88 
 
 		 888 aa  331  4e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  30.24 
 
 		 873 aa  317  6e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 931 aa  316  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  29.27 
 
 		 875 aa  314  5.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.72 
 
 		 933 aa  294  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 900 aa  293  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.62 
 
 		 870 aa  282  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.02 
 
 		 1480 aa  280  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  31.68 
 
 		 1584 aa  274  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  28.62 
 
 		 872 aa  273  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 		 1429 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.17 
 
 		 915 aa  271  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.49 
 
 		 1514 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  37.13 
 
 		 1434 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.13 
 
 		 1426 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.16 
 
 		 922 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 		 1476 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 		 1517 aa  264  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.5 
 
 		 874 aa  264  6e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.9 
 
 		 874 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  31.99 
 
 		 1493 aa  263  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  26.15 
 
 		 872 aa  263  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.05 
 
 		 1534 aa  262  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  28.44 
 
 		 914 aa  261  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.56 
 
 		 874 aa  260  7e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  31.99 
 
 		 1535 aa  260  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 		 1518 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.26 
 
 		 1480 aa  257  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.52 
 
 		 1523 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  36.35 
 
 		 1515 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.07 
 
 		 1505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.75 
 
 		 1508 aa  254  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.59 
 
 		 1516 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  30.73 
 
 		 1523 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.15 
 
 		 854 aa  252  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 1523 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.51 
 
 		 1451 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  35.79 
 
 		 1388 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.49 
 
 		 1502 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  35.7 
 
 		 1431 aa  248  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  28.93 
 
 		 1572 aa  247  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.77 
 
 		 1448 aa  247  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  37.63 
 
 		 1448 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  31.02 
 
 		 1567 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  30.46 
 
 		 925 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  33.94 
 
 		 1504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.01 
 
 		 1497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.32 
 
 		 1598 aa  245  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  35.32 
 
 		 1598 aa  245  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.32 
 
 		 1598 aa  245  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.32 
 
 		 1598 aa  245  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  28.66 
 
 		 1573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  35.38 
 
 		 1598 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  35.32 
 
 		 1599 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.32 
 
 		 1700 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  30.19 
 
 		 925 aa  244  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.82 
 
 		 1553 aa  244  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.69 
 
 		 1510 aa  243  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.43 
 
 		 1620 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.02 
 
 		 1412 aa  242  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  30.99 
 
 		 1632 aa  242  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  30.24 
 
 		 1509 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  33.6 
 
 		 1435 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.43 
 
 		 1513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.82 
 
 		 1538 aa  241  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  29.28 
 
 		 1544 aa  241  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.48 
 
 		 706 aa  241  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  27.76 
 
 		 1495 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.97 
 
 		 1539 aa  241  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.49 
 
 		 1626 aa  240  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.07 
 
 		 1538 aa  238  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>