More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4172 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 716 aa  1473    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.93 
 
 		 708 aa  724    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.41 
 
 		 710 aa  747    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.36 
 
 		 696 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.39 
 
 		 711 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 		 725 aa  353  5e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  33.23 
 
 		 734 aa  339  9e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  32.92 
 
 		 740 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.49 
 
 		 738 aa  334  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.28 
 
 		 743 aa  334  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  31.74 
 
 		 751 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.25 
 
 		 734 aa  331  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 		 755 aa  331  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  33.78 
 
 		 740 aa  327  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.13 
 
 		 741 aa  326  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  33.28 
 
 		 736 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.07 
 
 		 783 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.47 
 
 		 739 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  33 
 
 		 722 aa  323  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 744 aa  320  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.36 
 
 		 740 aa  313  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  31.86 
 
 		 723 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  32.58 
 
 		 746 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  31.2 
 
 		 743 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.5 
 
 		 736 aa  299  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.43 
 
 		 711 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.69 
 
 		 706 aa  263  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.72 
 
 		 698 aa  257  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.55 
 
 		 701 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 696 aa  249  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.75 
 
 		 716 aa  249  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  28.51 
 
 		 925 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  28.65 
 
 		 925 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 		 675 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  28.02 
 
 		 710 aa  231  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.84 
 
 		 711 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  30.45 
 
 		 702 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.92 
 
 		 694 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  29.36 
 
 		 694 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  27.56 
 
 		 753 aa  200  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.89 
 
 		 931 aa  190  9e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.74 
 
 		 933 aa  185  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.74 
 
 		 890 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.8 
 
 		 932 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.4 
 
 		 913 aa  177  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.79 
 
 		 903 aa  177  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.53 
 
 		 913 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.74 
 
 		 905 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 916 aa  174  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  26.88 
 
 		 943 aa  174  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.99 
 
 		 916 aa  172  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.88 
 
 		 898 aa  171  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 1476 aa  168  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 927 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 928 aa  164  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.42 
 
 		 937 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.46 
 
 		 897 aa  163  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  28.91 
 
 		 946 aa  161  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.9 
 
 		 970 aa  161  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.31 
 
 		 926 aa  160  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.28 
 
 		 915 aa  160  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  26.84 
 
 		 873 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  26.77 
 
 		 955 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  25.56 
 
 		 903 aa  158  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  25.54 
 
 		 1480 aa  157  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  26.9 
 
 		 954 aa  157  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 909 aa  157  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.73 
 
 		 1516 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.54 
 
 		 928 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.6 
 
 		 912 aa  155  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.16 
 
 		 972 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.83 
 
 		 854 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  26.09 
 
 		 1534 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  26.71 
 
 		 799 aa  154  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  25.04 
 
 		 939 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  26.55 
 
 		 1493 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  25.83 
 
 		 1523 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.83 
 
 		 1523 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  26.79 
 
 		 1513 aa  150  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26 
 
 		 1523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.91 
 
 		 844 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.59 
 
 		 833 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  25.49 
 
 		 1572 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.28 
 
 		 946 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1517 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.57 
 
 		 1514 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  25.87 
 
 		 875 aa  146  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  25.83 
 
 		 823 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.56 
 
 		 1539 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 799 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.66 
 
 		 1561 aa  144  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 1534 aa  143  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  25.64 
 
 		 1584 aa  143  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  26.28 
 
 		 1544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  28.16 
 
 		 831 aa  142  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.85 
 
 		 799 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  33.24 
 
 		 804 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  26.46 
 
 		 1531 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  26.4 
 
 		 1495 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.85 
 
 		 915 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>