More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1406 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  45.56 
 
 		 1741 aa  1179    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  47.25 
 
 		 1538 aa  1252    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  47.19 
 
 		 1538 aa  1253    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  59.28 
 
 		 1644 aa  1640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  36.29 
 
 		 1434 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.25 
 
 		 1538 aa  1256    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.13 
 
 		 1538 aa  1259    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  52.99 
 
 		 1536 aa  1236    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.53 
 
 		 1429 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.37 
 
 		 1538 aa  1258    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  55.58 
 
 		 1649 aa  1500    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  51.29 
 
 		 1480 aa  1288    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  48.23 
 
 		 1506 aa  1184    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  53.46 
 
 		 1660 aa  1126    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.74 
 
 		 1476 aa  1240    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  53.19 
 
 		 1536 aa  1245    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  59.42 
 
 		 1493 aa  1513    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  66.71 
 
 		 1567 aa  1854    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  36.44 
 
 		 1448 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  57.63 
 
 		 1534 aa  1608    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  56.69 
 
 		 1544 aa  1531    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  52.85 
 
 		 1536 aa  1234    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 		 1497 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 		 1426 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  62.4 
 
 		 1549 aa  1687    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.52 
 
 		 1510 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.58 
 
 		 1517 aa  1593    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  58.9 
 
 		 1572 aa  1574    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  57.77 
 
 		 1632 aa  1516    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  48.3 
 
 		 1531 aa  1297    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  67.26 
 
 		 1606 aa  1596    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  57.94 
 
 		 1523 aa  1580    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  55.12 
 
 		 1668 aa  1377    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  59.36 
 
 		 1509 aa  1559    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  56.63 
 
 		 1694 aa  1516    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  36.26 
 
 		 1448 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  57.91 
 
 		 1513 aa  1513    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.8 
 
 		 1502 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.93 
 
 		 1694 aa  1545    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  50.89 
 
 		 1618 aa  1361    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.28 
 
 		 1534 aa  988    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  47.25 
 
 		 1538 aa  1252    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  66.45 
 
 		 1535 aa  1778    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.06 
 
 		 1451 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  63.05 
 
 		 1584 aa  1750    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.14 
 
 		 1523 aa  1582    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.93 
 
 		 1516 aa  1724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  51.35 
 
 		 1523 aa  1292    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  90.52 
 
 		 1561 aa  2607    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.94 
 
 		 1523 aa  1580    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.39 
 
 		 1514 aa  1605    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.19 
 
 		 1538 aa  1254    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  50.13 
 
 		 1601 aa  1267    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.19 
 
 		 1613 aa  1699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.19 
 
 		 1525 aa  1248    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  62.35 
 
 		 1604 aa  1819    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.69 
 
 		 1553 aa  1279    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  58.68 
 
 		 1729 aa  1092    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  62.17 
 
 		 1620 aa  968    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1539 aa  2969    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  33.31 
 
 		 1435 aa  633  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  34.78 
 
 		 1431 aa  631  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  34.79 
 
 		 1504 aa  632  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  50.22 
 
 		 1577 aa  629  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  37.5 
 
 		 1388 aa  622  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 1381 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 		 1480 aa  616  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.43 
 
 		 1412 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  32.75 
 
 		 1379 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  39.71 
 
 		 1495 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  35.95 
 
 		 1573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 		 1475 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  39.8 
 
 		 1419 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  31.7 
 
 		 1688 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.47 
 
 		 1508 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  43.79 
 
 		 1515 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.78 
 
 		 875 aa  425  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.16 
 
 		 1505 aa  426  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.62 
 
 		 1518 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  43.49 
 
 		 1598 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  32.82 
 
 		 888 aa  416  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.79 
 
 		 1598 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  43.79 
 
 		 1599 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.81 
 
 		 1700 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  31.28 
 
 		 873 aa  411  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.15 
 
 		 1626 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.79 
 
 		 1598 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  43.79 
 
 		 1598 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.79 
 
 		 1598 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.38 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.7 
 
 		 872 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.45 
 
 		 874 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.15 
 
 		 874 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.39 
 
 		 874 aa  376  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  31.79 
 
 		 922 aa  360  8e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  30.77 
 
 		 915 aa  358  5e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31.51 
 
 		 872 aa  356  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  31.05 
 
 		 914 aa  346  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  31.13 
 
 		 941 aa  323  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 928 aa  307  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>