More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1206 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 711 aa  1410    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  41.67 
 
 		 925 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  41.53 
 
 		 925 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.54 
 
 		 701 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.88 
 
 		 696 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.89 
 
 		 706 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.38 
 
 		 711 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.5 
 
 		 675 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.45 
 
 		 694 aa  362  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.22 
 
 		 716 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  37.07 
 
 		 694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  43.98 
 
 		 702 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  36.75 
 
 		 753 aa  333  8e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.01 
 
 		 698 aa  308  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.31 
 
 		 711 aa  306  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  30.58 
 
 		 722 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.12 
 
 		 716 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.59 
 
 		 708 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 		 710 aa  287  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  29.23 
 
 		 740 aa  278  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  36.89 
 
 		 710 aa  276  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  30.55 
 
 		 736 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 738 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.18 
 
 		 734 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  31.71 
 
 		 751 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.07 
 
 		 744 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  29.46 
 
 		 740 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 739 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.91 
 
 		 783 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.53 
 
 		 755 aa  254  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.39 
 
 		 725 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.38 
 
 		 743 aa  252  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  31.52 
 
 		 746 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  31.61 
 
 		 734 aa  251  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  34.33 
 
 		 898 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.29 
 
 		 741 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  29.8 
 
 		 743 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.98 
 
 		 696 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  33.45 
 
 		 943 aa  240  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 903 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.09 
 
 		 932 aa  238  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.77 
 
 		 897 aa  237  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31 
 
 		 740 aa  237  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.62 
 
 		 933 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  32.04 
 
 		 723 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.26 
 
 		 931 aa  228  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.02 
 
 		 736 aa  227  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  32.58 
 
 		 939 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.48 
 
 		 890 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 		 854 aa  220  7e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  28.98 
 
 		 955 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.15 
 
 		 909 aa  217  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 		 916 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 928 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.9 
 
 		 970 aa  214  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  31.2 
 
 		 903 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.66 
 
 		 927 aa  213  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.71 
 
 		 972 aa  211  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.48 
 
 		 944 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 928 aa  209  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.16 
 
 		 946 aa  209  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 937 aa  207  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.14 
 
 		 916 aa  205  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 		 912 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 		 926 aa  200  7.999999999999999e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 915 aa  200  9e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  29.97 
 
 		 954 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 913 aa  196  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.88 
 
 		 913 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 		 905 aa  194  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.44 
 
 		 1381 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 946 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.43 
 
 		 1412 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  26.71 
 
 		 1688 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  30.37 
 
 		 1523 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.37 
 
 		 1523 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 		 1523 aa  171  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  30.03 
 
 		 1515 aa  170  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.74 
 
 		 1508 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.91 
 
 		 1505 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.07 
 
 		 873 aa  167  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.54 
 
 		 1518 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.61 
 
 		 1480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 		 1426 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.33 
 
 		 870 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.62 
 
 		 1534 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.19 
 
 		 1497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  32.1 
 
 		 1434 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.41 
 
 		 1514 aa  163  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.89 
 
 		 1451 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  32.11 
 
 		 1536 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  31.83 
 
 		 1379 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.46 
 
 		 1517 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  31.85 
 
 		 1536 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  31.96 
 
 		 1536 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  30.4 
 
 		 1513 aa  161  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  27.7 
 
 		 888 aa  159  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  26.44 
 
 		 875 aa  157  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 		 1429 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  28.95 
 
 		 1431 aa  156  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>