More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2002 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.9 
 
 		 739 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  74.46 
 
 		 751 aa  1108    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.75 
 
 		 755 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 746 aa  1497    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.17 
 
 		 738 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.18 
 
 		 734 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  43.74 
 
 		 723 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  43.54 
 
 		 736 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.08 
 
 		 744 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.48 
 
 		 743 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.19 
 
 		 783 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  43.88 
 
 		 740 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.74 
 
 		 740 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  41.34 
 
 		 743 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  41.47 
 
 		 734 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.36 
 
 		 725 aa  445  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.86 
 
 		 736 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.83 
 
 		 741 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.91 
 
 		 711 aa  354  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  32.33 
 
 		 740 aa  352  1e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  33.12 
 
 		 722 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.09 
 
 		 710 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.86 
 
 		 708 aa  340  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.58 
 
 		 716 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.85 
 
 		 696 aa  271  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.36 
 
 		 711 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  28.95 
 
 		 925 aa  241  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  28.8 
 
 		 925 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.27 
 
 		 701 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.61 
 
 		 706 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.96 
 
 		 694 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  31.4 
 
 		 694 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.07 
 
 		 716 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.11 
 
 		 972 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.78 
 
 		 711 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 		 698 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.68 
 
 		 696 aa  203  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.37 
 
 		 913 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2125  hypothetical protein  55.14 
 
 		 197 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  29.21 
 
 		 702 aa  200  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  28.31 
 
 		 943 aa  197  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2277  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.59 
 
 		 197 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.790294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.92 
 
 		 890 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.93 
 
 		 675 aa  192  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  26.99 
 
 		 939 aa  191  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  32.22 
 
 		 710 aa  189  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.1 
 
 		 898 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  26.38 
 
 		 903 aa  177  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.92 
 
 		 912 aa  177  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  27.98 
 
 		 955 aa  177  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  27.84 
 
 		 946 aa  174  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  27.38 
 
 		 954 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 		 916 aa  172  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.11 
 
 		 916 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.07 
 
 		 909 aa  171  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.19 
 
 		 928 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.65 
 
 		 933 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.69 
 
 		 897 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.04 
 
 		 970 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  28.12 
 
 		 753 aa  168  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.9 
 
 		 928 aa  167  5e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.72 
 
 		 937 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 		 932 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.52 
 
 		 927 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.08 
 
 		 903 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.39 
 
 		 926 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.28 
 
 		 913 aa  163  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1516 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  29.08 
 
 		 1535 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  36.02 
 
 		 1573 aa  161  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.93 
 
 		 905 aa  160  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  28.16 
 
 		 1480 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  34.13 
 
 		 1379 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  30 
 
 		 1493 aa  158  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 931 aa  157  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.55 
 
 		 944 aa  157  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  29.38 
 
 		 1618 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  34.31 
 
 		 807 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  33.06 
 
 		 915 aa  156  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.5 
 
 		 915 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  28.92 
 
 		 1584 aa  155  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 		 1502 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.13 
 
 		 1412 aa  154  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  28.28 
 
 		 1531 aa  151  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  34.09 
 
 		 1509 aa  151  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  27.23 
 
 		 1649 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 		 1534 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 946 aa  150  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  27.85 
 
 		 1572 aa  150  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  32.65 
 
 		 922 aa  150  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.85 
 
 		 1508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.75 
 
 		 888 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  27.05 
 
 		 1632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  30.97 
 
 		 807 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  26.91 
 
 		 875 aa  149  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.92 
 
 		 1620 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.35 
 
 		 854 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.92 
 
 		 1480 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  32.52 
 
 		 914 aa  147  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  29.94 
 
 		 1567 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>