More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0189 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  50.75 
 
 		 740 aa  737    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.76 
 
 		 736 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.55 
 
 		 740 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.71 
 
 		 743 aa  1141    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  49.93 
 
 		 743 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  51.5 
 
 		 736 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 734 aa  1509    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.5 
 
 		 738 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.72 
 
 		 744 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  48.12 
 
 		 734 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.22 
 
 		 783 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  45.42 
 
 		 723 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.76 
 
 		 755 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  42.43 
 
 		 751 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  42.18 
 
 		 746 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.22 
 
 		 725 aa  515  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 		 739 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  34.89 
 
 		 740 aa  398  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.47 
 
 		 741 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.69 
 
 		 710 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.85 
 
 		 711 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  32.74 
 
 		 722 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.14 
 
 		 708 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.25 
 
 		 716 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 		 696 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.07 
 
 		 701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  30.33 
 
 		 925 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  30.04 
 
 		 925 aa  250  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.97 
 
 		 711 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.64 
 
 		 706 aa  241  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.46 
 
 		 696 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.21 
 
 		 711 aa  220  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.18 
 
 		 675 aa  214  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  28.98 
 
 		 753 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 698 aa  202  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.08 
 
 		 933 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 931 aa  201  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  29.02 
 
 		 694 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.64 
 
 		 716 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.12 
 
 		 694 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  27.21 
 
 		 939 aa  195  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  33.21 
 
 		 702 aa  194  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.1 
 
 		 909 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.47 
 
 		 972 aa  191  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  26.06 
 
 		 943 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.86 
 
 		 898 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  29.2 
 
 		 955 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  34.84 
 
 		 710 aa  184  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.22 
 
 		 913 aa  181  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.25 
 
 		 897 aa  177  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.9 
 
 		 926 aa  177  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  25.64 
 
 		 1688 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  27.16 
 
 		 946 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  27.07 
 
 		 954 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.35 
 
 		 903 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.82 
 
 		 913 aa  171  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.24 
 
 		 890 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.06 
 
 		 932 aa  162  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.17 
 
 		 944 aa  160  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 912 aa  159  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  27.62 
 
 		 873 aa  157  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.8 
 
 		 946 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.49 
 
 		 905 aa  155  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.19 
 
 		 854 aa  154  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.27 
 
 		 916 aa  154  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 937 aa  152  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 		 927 aa  151  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.75 
 
 		 916 aa  150  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 		 928 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  30.81 
 
 		 872 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.07 
 
 		 928 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  32.79 
 
 		 835 aa  147  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  28.12 
 
 		 807 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.52 
 
 		 799 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  32.96 
 
 		 799 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  26.68 
 
 		 888 aa  142  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  27.81 
 
 		 1379 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  25.41 
 
 		 903 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.81 
 
 		 1412 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.63 
 
 		 799 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  26.4 
 
 		 1388 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.14 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.99 
 
 		 849 aa  140  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 819 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.96 
 
 		 915 aa  139  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  28.61 
 
 		 875 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  27.91 
 
 		 1448 aa  138  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  30.87 
 
 		 853 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.93 
 
 		 922 aa  137  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  30.85 
 
 		 831 aa  136  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  31.18 
 
 		 1448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.38 
 
 		 870 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.69 
 
 		 970 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  29.11 
 
 		 1515 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.16 
 
 		 915 aa  135  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  25.53 
 
 		 846 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.34 
 
 		 1480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.12 
 
 		 820 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  27.75 
 
 		 807 aa  134  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 1534 aa  134  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>