More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0604 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  99.14 
 
 
925 aa  1840    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  100 
 
 
925 aa  1858    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.11 
 
 
701 aa  816    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.59 
 
 
706 aa  765    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.69 
 
 
711 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.82 
 
 
696 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.78 
 
 
711 aa  399  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.77 
 
 
694 aa  389  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.34 
 
 
675 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  38.24 
 
 
694 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  37.9 
 
 
702 aa  363  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.06 
 
 
716 aa  345  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 
698 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  38.33 
 
 
753 aa  334  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  37.39 
 
 
710 aa  330  7e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.38 
 
 
711 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.49 
 
 
708 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.9 
 
 
710 aa  277  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  31.42 
 
 
722 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  30.88 
 
 
740 aa  274  5.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.35 
 
 
738 aa  272  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  30.96 
 
 
736 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.49 
 
 
734 aa  268  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
931 aa  267  7e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 
725 aa  267  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  30.84 
 
 
723 aa  264  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34 
 
 
937 aa  261  3e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.88 
 
 
903 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  31.8 
 
 
740 aa  260  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.79 
 
 
716 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.69 
 
 
744 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.94 
 
 
927 aa  258  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.08 
 
 
743 aa  257  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  31.46 
 
 
898 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.78 
 
 
736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.9 
 
 
932 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.68 
 
 
897 aa  251  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.98 
 
 
928 aa  250  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.1 
 
 
741 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.46 
 
 
928 aa  247  6.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  29.98 
 
 
955 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.85 
 
 
783 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  30.72 
 
 
734 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  30.46 
 
 
743 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 
909 aa  243  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.64 
 
 
739 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.47 
 
 
755 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 
916 aa  240  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  31.93 
 
 
939 aa  239  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.58 
 
 
890 aa  236  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.13 
 
 
916 aa  234  6e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
970 aa  232  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  28.91 
 
 
746 aa  232  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  30.73 
 
 
943 aa  231  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  30.97 
 
 
751 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
912 aa  229  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.41 
 
 
946 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 
740 aa  228  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  29.83 
 
 
903 aa  228  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 
933 aa  228  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.18 
 
 
696 aa  226  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.49 
 
 
972 aa  224  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  30.34 
 
 
954 aa  223  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.57 
 
 
944 aa  222  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.7 
 
 
915 aa  214  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.52 
 
 
913 aa  213  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.12 
 
 
926 aa  211  8e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.63 
 
 
1412 aa  207  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  29.03 
 
 
1688 aa  205  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.2 
 
 
905 aa  202  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.01 
 
 
801 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.29 
 
 
913 aa  193  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.03 
 
 
854 aa  192  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.03 
 
 
873 aa  188  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.04 
 
 
1480 aa  188  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
946 aa  183  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 
824 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.11 
 
 
874 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  27.44 
 
 
874 aa  180  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.44 
 
 
874 aa  180  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  27.41 
 
 
888 aa  180  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  34.88 
 
 
799 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  29.73 
 
 
807 aa  179  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.73 
 
 
1381 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  29.4 
 
 
1567 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  27.16 
 
 
875 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  29.7 
 
 
1515 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.35 
 
 
799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.47 
 
 
870 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.05 
 
 
799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.12 
 
 
1508 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
809 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  28.77 
 
 
1379 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.52 
 
 
1480 aa  173  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  31.24 
 
 
807 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.6 
 
 
806 aa  173  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.95 
 
 
1505 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  28.69 
 
 
1535 aa  173  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
1518 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  28.93 
 
 
1495 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>