More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1333 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.46 
 
 
926 aa  687    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.33 
 
 
915 aa  1411    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
912 aa  1817    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.02 
 
 
916 aa  1464    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.63 
 
 
916 aa  1382    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.13 
 
 
932 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  37.4 
 
 
955 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.16 
 
 
944 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.25 
 
 
928 aa  557  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.16 
 
 
927 aa  550  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.66 
 
 
928 aa  531  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.75 
 
 
937 aa  527  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.5 
 
 
909 aa  528  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.34 
 
 
946 aa  520  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  36.53 
 
 
939 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  36.96 
 
 
898 aa  515  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.84 
 
 
903 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.97 
 
 
897 aa  512  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.96 
 
 
905 aa  499  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  35.43 
 
 
946 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.87 
 
 
970 aa  496  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.88 
 
 
972 aa  497  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  36 
 
 
903 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  35.69 
 
 
943 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.26 
 
 
890 aa  495  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.06 
 
 
913 aa  489  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  34.67 
 
 
954 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.94 
 
 
913 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  32.97 
 
 
888 aa  334  4e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  33.57 
 
 
870 aa  332  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.44 
 
 
873 aa  318  3e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  31.26 
 
 
1688 aa  318  3e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  36.67 
 
 
872 aa  318  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  30.46 
 
 
875 aa  317  8e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  38 
 
 
1480 aa  305  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  32.53 
 
 
1495 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  30.53 
 
 
874 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  30.12 
 
 
874 aa  300  7e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  31.42 
 
 
922 aa  300  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.35 
 
 
874 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.7 
 
 
1476 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.38 
 
 
1502 aa  296  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.71 
 
 
872 aa  294  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.06 
 
 
915 aa  291  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.83 
 
 
931 aa  286  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  35.09 
 
 
914 aa  282  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.84 
 
 
1514 aa  282  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
900 aa  281  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  36.68 
 
 
1523 aa  280  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.68 
 
 
1523 aa  280  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.86 
 
 
1523 aa  280  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.59 
 
 
1412 aa  279  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.77 
 
 
1538 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  31.24 
 
 
1601 aa  279  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.31 
 
 
1388 aa  277  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.64 
 
 
1538 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.64 
 
 
1538 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  37.13 
 
 
1535 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  30.76 
 
 
1538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  30.76 
 
 
1538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.88 
 
 
1538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.78 
 
 
1517 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  30.76 
 
 
1538 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  34.53 
 
 
1632 aa  274  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  29.81 
 
 
1573 aa  274  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  31.69 
 
 
1509 aa  273  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  31.72 
 
 
1544 aa  273  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.51 
 
 
933 aa  273  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  31.04 
 
 
1567 aa  273  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.16 
 
 
1475 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.64 
 
 
1525 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  34.05 
 
 
1506 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.8 
 
 
1493 aa  269  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.86 
 
 
1497 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.3 
 
 
1516 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  30.68 
 
 
941 aa  265  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  32.09 
 
 
1419 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  34.76 
 
 
1534 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  36.45 
 
 
1584 aa  263  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.57 
 
 
1534 aa  261  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  29.41 
 
 
1431 aa  260  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  31.48 
 
 
1513 aa  260  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 
1561 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  33.48 
 
 
1649 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.24 
 
 
819 aa  258  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.25 
 
 
1508 aa  257  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 
1505 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  30.48 
 
 
1694 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  30.28 
 
 
1504 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  30.34 
 
 
1523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.98 
 
 
1480 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
1553 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  34.52 
 
 
1515 aa  254  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.33 
 
 
1510 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.2 
 
 
1539 aa  253  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  34.2 
 
 
1620 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  32.9 
 
 
1531 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  28.75 
 
 
1435 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  31.07 
 
 
1448 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.15 
 
 
824 aa  251  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>