More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1014 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  49.18 
 
 		 1577 aa  889    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  48.52 
 
 		 1538 aa  1317    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  48.46 
 
 		 1538 aa  1316    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.11 
 
 		 1517 aa  1661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  51.73 
 
 		 1660 aa  1323    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  47.97 
 
 		 1618 aa  1257    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  47.5 
 
 		 1536 aa  1165    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.64 
 
 		 1429 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  48.65 
 
 		 1538 aa  1318    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  57.28 
 
 		 1584 aa  1542    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  58.19 
 
 		 1535 aa  1467    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  54.23 
 
 		 1549 aa  1392    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  48.52 
 
 		 1538 aa  1317    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  44.96 
 
 		 1741 aa  1176    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.45 
 
 		 1476 aa  1169    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  56.71 
 
 		 1604 aa  1585    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  52.92 
 
 		 1644 aa  1415    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  48.53 
 
 		 1538 aa  1318    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  47.52 
 
 		 1536 aa  1171    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.13 
 
 		 1502 aa  675    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  57.76 
 
 		 1567 aa  1526    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.75 
 
 		 1523 aa  1704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  51.65 
 
 		 1601 aa  1337    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  53.75 
 
 		 1729 aa  1556    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  50.25 
 
 		 1534 aa  1313    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 		 1493 aa  2921    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  52.23 
 
 		 1632 aa  1353    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  47.5 
 
 		 1536 aa  1167    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  47.27 
 
 		 1531 aa  1227    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  49.51 
 
 		 1480 aa  1220    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  61.68 
 
 		 1523 aa  1705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  48.2 
 
 		 1523 aa  1199    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  48.46 
 
 		 1538 aa  1316    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  57.68 
 
 		 1606 aa  1330    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.04 
 
 		 1694 aa  1610    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  56.79 
 
 		 1572 aa  1514    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.41 
 
 		 1534 aa  920    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  50.98 
 
 		 1668 aa  1247    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.45 
 
 		 1553 aa  1232    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.07 
 
 		 1516 aa  1627    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  55.32 
 
 		 1509 aa  1397    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.79 
 
 		 1539 aa  1515    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.68 
 
 		 1523 aa  1705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.98 
 
 		 1514 aa  1682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  61.41 
 
 		 1513 aa  1630    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  48.55 
 
 		 1525 aa  1314    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  55.12 
 
 		 1620 aa  1485    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.18 
 
 		 1561 aa  1513    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  48.68 
 
 		 1538 aa  1324    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  61.86 
 
 		 1544 aa  1720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.73 
 
 		 1613 aa  1474    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  51.57 
 
 		 1649 aa  1321    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  45.38 
 
 		 1506 aa  1088    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  51.85 
 
 		 1694 aa  1385    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  35.06 
 
 		 1434 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 1426 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 1497 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  35.1 
 
 		 1448 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  34.93 
 
 		 1448 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.72 
 
 		 1451 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  36.37 
 
 		 1388 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  34.32 
 
 		 1504 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.24 
 
 		 1412 aa  602  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  33.63 
 
 		 1431 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.1 
 
 		 1510 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.77 
 
 		 1518 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.54 
 
 		 1381 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.7 
 
 		 1480 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  31.94 
 
 		 1435 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.18 
 
 		 1508 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.98 
 
 		 1505 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  38.2 
 
 		 1495 aa  582  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  36.15 
 
 		 1573 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  38.32 
 
 		 1379 aa  529  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.57 
 
 		 1688 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  39.53 
 
 		 1419 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.7 
 
 		 1475 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  33.37 
 
 		 888 aa  435  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.86 
 
 		 1598 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  43.19 
 
 		 1515 aa  426  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  42.86 
 
 		 1598 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  42.86 
 
 		 1599 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.86 
 
 		 1598 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.86 
 
 		 1598 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.7 
 
 		 1700 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  42.7 
 
 		 1598 aa  423  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.06 
 
 		 1626 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.26 
 
 		 875 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  31.24 
 
 		 873 aa  406  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.4 
 
 		 872 aa  392  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  31.1 
 
 		 870 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.32 
 
 		 874 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.81 
 
 		 915 aa  380  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.43 
 
 		 874 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.37 
 
 		 874 aa  377  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31.28 
 
 		 872 aa  363  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  32.03 
 
 		 914 aa  358  5e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  31.49 
 
 		 922 aa  354  7e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 941 aa  342  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  29.79 
 
 		 1523 aa  308  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>