More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.68 
 
 		 1538 aa  1260    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  47.66 
 
 		 1538 aa  1253    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  47.59 
 
 		 1538 aa  1252    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  55.92 
 
 		 1649 aa  1488    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.59 
 
 		 1538 aa  1251    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.36 
 
 		 1553 aa  1248    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  47.66 
 
 		 1538 aa  1253    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.73 
 
 		 1525 aa  1248    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  46.51 
 
 		 1506 aa  1150    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  55.89 
 
 		 1632 aa  1471    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  59.65 
 
 		 1620 aa  929    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  56.68 
 
 		 1513 aa  1511    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.37 
 
 		 1561 aa  1676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.72 
 
 		 1538 aa  1257    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  50.59 
 
 		 1660 aa  1290    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.42 
 
 		 1613 aa  1645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  57.41 
 
 		 1604 aa  1692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  47.68 
 
 		 1601 aa  1211    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  50.72 
 
 		 1536 aa  1236    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  48.54 
 
 		 1618 aa  1304    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  61.01 
 
 		 1567 aa  1717    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  59.61 
 
 		 1584 aa  1667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  49.34 
 
 		 1523 aa  1236    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  75.75 
 
 		 1606 aa  1900    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  48.46 
 
 		 1577 aa  860    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  54.61 
 
 		 1544 aa  1494    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  50.68 
 
 		 1534 aa  1354    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  49.75 
 
 		 1480 aa  1279    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  46.82 
 
 		 1531 aa  1276    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  55.82 
 
 		 1523 aa  1545    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  100 
 
 		 1549 aa  3011    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  53.67 
 
 		 1668 aa  1342    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.73 
 
 		 1517 aa  1531    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  47.73 
 
 		 1538 aa  1260    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  46.81 
 
 		 1741 aa  1219    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.71 
 
 		 1694 aa  1524    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  54.04 
 
 		 1493 aa  1397    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  63.53 
 
 		 1535 aa  1723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  58.49 
 
 		 1572 aa  1575    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.13 
 
 		 1534 aa  971    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  50.66 
 
 		 1536 aa  1237    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.98 
 
 		 1523 aa  1544    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  55.71 
 
 		 1694 aa  1518    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.65 
 
 		 1539 aa  1689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.29 
 
 		 1516 aa  1610    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.82 
 
 		 1523 aa  1545    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.21 
 
 		 1514 aa  1562    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  60.66 
 
 		 1644 aa  1377    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  57.73 
 
 		 1509 aa  1491    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  50.79 
 
 		 1536 aa  1236    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.6 
 
 		 1476 aa  1236    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  50.17 
 
 		 1729 aa  1475    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.16 
 
 		 1502 aa  632  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 		 1429 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.08 
 
 		 1510 aa  622  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.58 
 
 		 1497 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  34.76 
 
 		 1448 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  34.79 
 
 		 1504 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  32.87 
 
 		 1435 aa  619  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.66 
 
 		 1451 aa  619  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.91 
 
 		 1412 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  34.51 
 
 		 1448 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 		 1426 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  34.04 
 
 		 1434 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  33.01 
 
 		 1431 aa  606  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.96 
 
 		 1381 aa  601  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  39.17 
 
 		 1495 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.06 
 
 		 1480 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.47 
 
 		 1518 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  35.61 
 
 		 1388 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  35.73 
 
 		 1573 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.38 
 
 		 1475 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.52 
 
 		 1688 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.93 
 
 		 875 aa  437  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  42.86 
 
 		 1515 aa  426  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 		 1508 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  33.48 
 
 		 888 aa  425  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  32.36 
 
 		 873 aa  424  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.24 
 
 		 1505 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  41.49 
 
 		 1598 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.64 
 
 		 1598 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  41.64 
 
 		 1599 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.49 
 
 		 1700 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  41.64 
 
 		 1598 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.64 
 
 		 1598 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.64 
 
 		 1598 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.18 
 
 		 1626 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.15 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  32.1 
 
 		 915 aa  386  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.01 
 
 		 874 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.83 
 
 		 874 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.91 
 
 		 874 aa  380  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  27.97 
 
 		 872 aa  377  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  32.18 
 
 		 922 aa  374  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  32.22 
 
 		 872 aa  370  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  31.87 
 
 		 914 aa  366  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 941 aa  335  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  30.51 
 
 		 1523 aa  312  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.99 
 
 		 928 aa  300  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.09 
 
 		 927 aa  300  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>