More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17730 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  45.57 
 
 		 1577 aa  823    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  43.87 
 
 		 1538 aa  1174    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  43.81 
 
 		 1538 aa  1172    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  46.68 
 
 		 1523 aa  1169    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  50.78 
 
 		 1644 aa  1404    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.56 
 
 		 1538 aa  1169    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.97 
 
 		 1561 aa  1413    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  47.56 
 
 		 1618 aa  1292    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  57.45 
 
 		 1584 aa  1627    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  57.47 
 
 		 1620 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.03 
 
 		 1476 aa  1089    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.52 
 
 		 1613 aa  1392    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  43.32 
 
 		 1506 aa  1063    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.81 
 
 		 1539 aa  1173    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  44.56 
 
 		 1601 aa  931    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.39 
 
 		 1517 aa  1347    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.61 
 
 		 1538 aa  1170    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  45.64 
 
 		 1536 aa  1095    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  52.11 
 
 		 1509 aa  1350    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  53.25 
 
 		 1567 aa  1460    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  42.26 
 
 		 1741 aa  1094    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  43.87 
 
 		 1538 aa  1174    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  42.87 
 
 		 1480 aa  1061    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  44.77 
 
 		 1536 aa  1082    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  52.84 
 
 		 1649 aa  1422    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  51.79 
 
 		 1632 aa  1386    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  43.82 
 
 		 1531 aa  1170    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  49.73 
 
 		 1523 aa  1363    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  49.34 
 
 		 1729 aa  1443    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  44.71 
 
 		 1536 aa  1082    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  50.36 
 
 		 1513 aa  1307    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.45 
 
 		 1694 aa  1441    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  51.04 
 
 		 1544 aa  1398    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.57 
 
 		 1534 aa  882    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  53.15 
 
 		 1535 aa  1423    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  52.31 
 
 		 1668 aa  1338    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.53 
 
 		 1516 aa  1508    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  45.81 
 
 		 1534 aa  974    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  56 
 
 		 1572 aa  1288    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.03 
 
 		 1523 aa  1366    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 		 1523 aa  1363    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.66 
 
 		 1514 aa  1376    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  52.18 
 
 		 1604 aa  1530    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  50.89 
 
 		 1549 aa  1343    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.79 
 
 		 1538 aa  1174    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.66 
 
 		 1553 aa  1149    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.81 
 
 		 1525 aa  1172    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  51.97 
 
 		 1493 aa  1363    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.61 
 
 		 1538 aa  1170    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  52.5 
 
 		 1606 aa  1232    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  100 
 
 		 1660 aa  3206    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  52.69 
 
 		 1694 aa  1434    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.61 
 
 		 1502 aa  549  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.88 
 
 		 1510 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 		 1497 aa  513  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  33 
 
 		 1495 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.24 
 
 		 1412 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  28.85 
 
 		 1435 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  32.12 
 
 		 1504 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.23 
 
 		 1381 aa  377  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 1451 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.46 
 
 		 1518 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  31.71 
 
 		 1448 aa  362  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  33.24 
 
 		 1419 aa  360  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  31.6 
 
 		 1448 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  29.61 
 
 		 1431 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.79 
 
 		 1429 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  30.69 
 
 		 1388 aa  354  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  31.54 
 
 		 1573 aa  329  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  30.16 
 
 		 1523 aa  310  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  33.65 
 
 		 1379 aa  291  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  25.58 
 
 		 870 aa  279  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  34.59 
 
 		 1434 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 		 1426 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 		 1475 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  28.82 
 
 		 1688 aa  260  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  26.76 
 
 		 873 aa  256  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  26.78 
 
 		 872 aa  253  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 		 1480 aa  248  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  26.37 
 
 		 875 aa  242  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  27.69 
 
 		 941 aa  242  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.78 
 
 		 944 aa  241  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  30.43 
 
 		 943 aa  228  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 900 aa  219  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.34 
 
 		 1508 aa  214  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.08 
 
 		 1505 aa  211  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  25.6 
 
 		 955 aa  211  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  43.04 
 
 		 1515 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  38.73 
 
 		 1598 aa  209  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.73 
 
 		 1598 aa  208  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.73 
 
 		 1700 aa  208  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  38.73 
 
 		 1599 aa  208  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  38.73 
 
 		 1598 aa  208  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.73 
 
 		 1598 aa  208  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.73 
 
 		 1598 aa  208  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.93 
 
 		 1626 aa  207  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.37 
 
 		 884 aa  204  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  27.83 
 
 		 914 aa  202  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  26.45 
 
 		 888 aa  202  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  24.01 
 
 		 872 aa  202  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>