More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2453 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  43.36 
 
 		 1538 aa  1133    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  43.3 
 
 		 1538 aa  1132    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  53.62 
 
 		 1660 aa  1348    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  58.01 
 
 		 1649 aa  1597    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.92 
 
 		 1538 aa  1126    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.4 
 
 		 1517 aa  1362    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 		 1668 aa  3185    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.55 
 
 		 1523 aa  1380    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.3 
 
 		 1525 aa  1129    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.52 
 
 		 1561 aa  1459    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  54.19 
 
 		 1549 aa  1415    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  56.98 
 
 		 1534 aa  713    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.08 
 
 		 1538 aa  1130    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.84 
 
 		 1613 aa  1401    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.03 
 
 		 1538 aa  1137    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  51.74 
 
 		 1493 aa  1314    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  51.44 
 
 		 1544 aa  1390    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.01 
 
 		 1476 aa  908    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  48.64 
 
 		 1536 aa  886    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  60.39 
 
 		 1632 aa  1649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  55.17 
 
 		 1567 aa  1518    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  52.83 
 
 		 1604 aa  1521    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  45.29 
 
 		 1577 aa  778    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  47.58 
 
 		 1523 aa  1201    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  43.08 
 
 		 1741 aa  1090    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1538 aa  1133    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  51.82 
 
 		 1618 aa  1438    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  49.3 
 
 		 1536 aa  887    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  48.2 
 
 		 1601 aa  951    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  45.65 
 
 		 1531 aa  1215    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  43.3 
 
 		 1538 aa  1130    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  50.49 
 
 		 1523 aa  1389    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  54.75 
 
 		 1509 aa  1423    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.63 
 
 		 1694 aa  1415    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  50.34 
 
 		 1729 aa  1428    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  58.07 
 
 		 1694 aa  1602    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  45.16 
 
 		 1480 aa  1149    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.66 
 
 		 1553 aa  927    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.61 
 
 		 1516 aa  1469    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  44.85 
 
 		 1506 aa  1105    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  51.42 
 
 		 1620 aa  1432    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  54.28 
 
 		 1572 aa  1450    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 		 1523 aa  1389    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.16 
 
 		 1514 aa  1382    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.69 
 
 		 1539 aa  1448    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  56.87 
 
 		 1584 aa  1565    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  55.44 
 
 		 1535 aa  1473    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  56.38 
 
 		 1606 aa  1307    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  51.41 
 
 		 1513 aa  1326    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  51.91 
 
 		 1644 aa  1404    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  49.05 
 
 		 1536 aa  884    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.28 
 
 		 1534 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  35.66 
 
 		 1388 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.13 
 
 		 1510 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.56 
 
 		 1429 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.19 
 
 		 1412 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 		 1451 aa  404  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  33 
 
 		 1448 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 		 1497 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  32.38 
 
 		 1504 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  32.35 
 
 		 1448 aa  397  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  30.11 
 
 		 875 aa  390  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  31.24 
 
 		 1434 aa  387  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 		 1426 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.68 
 
 		 888 aa  387  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  30.45 
 
 		 1431 aa  380  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.89 
 
 		 1502 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 		 1480 aa  370  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  30.84 
 
 		 1435 aa  370  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  37.31 
 
 		 1495 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  30.13 
 
 		 873 aa  363  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  34.36 
 
 		 1573 aa  354  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.97 
 
 		 915 aa  348  7e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.91 
 
 		 870 aa  343  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 		 1381 aa  342  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  30.2 
 
 		 872 aa  333  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  30.29 
 
 		 914 aa  329  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.18 
 
 		 874 aa  324  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  26.72 
 
 		 874 aa  319  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.31 
 
 		 922 aa  313  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  30.64 
 
 		 941 aa  312  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  36.41 
 
 		 1379 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.56 
 
 		 874 aa  308  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  29.36 
 
 		 1523 aa  300  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  38.07 
 
 		 1419 aa  268  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.46 
 
 		 1688 aa  265  4e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.61 
 
 		 972 aa  260  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  30.75 
 
 		 853 aa  246  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  30.61 
 
 		 951 aa  234  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 903 aa  229  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.73 
 
 		 1475 aa  229  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.31 
 
 		 824 aa  228  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  30.76 
 
 		 908 aa  228  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  30.15 
 
 		 825 aa  225  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  31.31 
 
 		 835 aa  225  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  46.37 
 
 		 1599 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.37 
 
 		 1598 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  46.37 
 
 		 1598 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.37 
 
 		 1598 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.37 
 
 		 1598 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>