More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1352 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1352  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 854 aa  1674    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0456813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 931 aa  292  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  36.02 
 
 		 898 aa  277  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.19 
 
 		 933 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.7 
 
 		 944 aa  272  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.9 
 
 		 927 aa  272  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 		 909 aa  271  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 970 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.8 
 
 		 897 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 937 aa  259  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.88 
 
 		 928 aa  259  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.8 
 
 		 916 aa  259  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  31.93 
 
 		 903 aa  257  7e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  30.38 
 
 		 955 aa  256  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.14 
 
 		 932 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.97 
 
 		 903 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.43 
 
 		 916 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  31.48 
 
 		 943 aa  255  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.89 
 
 		 928 aa  255  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  32 
 
 		 939 aa  248  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.69 
 
 		 946 aa  248  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 913 aa  247  8e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.17 
 
 		 890 aa  246  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.24 
 
 		 972 aa  242  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  35.05 
 
 		 954 aa  242  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.43 
 
 		 912 aa  239  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.56 
 
 		 926 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 905 aa  231  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.01 
 
 		 946 aa  228  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  29.97 
 
 		 1688 aa  227  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31 
 
 		 872 aa  227  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 		 915 aa  226  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.82 
 
 		 711 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.58 
 
 		 913 aa  224  7e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  30.68 
 
 		 870 aa  224  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  32.01 
 
 		 915 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  33.14 
 
 		 1448 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  30.8 
 
 		 873 aa  217  7e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  30.64 
 
 		 874 aa  217  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 1517 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  33.14 
 
 		 1448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 696 aa  213  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.73 
 
 		 872 aa  211  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  30.13 
 
 		 874 aa  210  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.79 
 
 		 1514 aa  210  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  36.49 
 
 		 941 aa  209  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.98 
 
 		 874 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  29.08 
 
 		 875 aa  208  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.37 
 
 		 888 aa  207  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.52 
 
 		 675 aa  206  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.26 
 
 		 922 aa  205  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.24 
 
 		 900 aa  204  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  36.21 
 
 		 914 aa  203  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.81 
 
 		 1412 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 		 1505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  32.8 
 
 		 1435 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  29.81 
 
 		 1480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.27 
 
 		 1480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.34 
 
 		 1493 aa  201  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.66 
 
 		 1518 aa  201  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  32.48 
 
 		 925 aa  201  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 1508 aa  201  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  33.67 
 
 		 1515 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.77 
 
 		 1497 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  32.48 
 
 		 925 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.72 
 
 		 1523 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 		 1523 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.33 
 
 		 711 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  33.45 
 
 		 1388 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.5 
 
 		 1523 aa  197  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.91 
 
 		 716 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.7 
 
 		 1510 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.53 
 
 		 694 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.78 
 
 		 1538 aa  195  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  31.54 
 
 		 1544 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.69 
 
 		 1502 aa  195  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.28 
 
 		 1538 aa  194  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.63 
 
 		 1538 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  35.05 
 
 		 1504 aa  193  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  28.49 
 
 		 1538 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  28.49 
 
 		 1538 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  29.88 
 
 		 1572 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.49 
 
 		 1538 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1538 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  31.15 
 
 		 1584 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 		 1476 aa  191  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.17 
 
 		 706 aa  190  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  35.65 
 
 		 694 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  31.64 
 
 		 1567 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.62 
 
 		 1700 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  29.86 
 
 		 1513 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.68 
 
 		 701 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  32.89 
 
 		 1599 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  31.79 
 
 		 1434 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.52 
 
 		 1626 aa  188  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.35 
 
 		 1525 aa  188  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.62 
 
 		 1426 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.95 
 
 		 708 aa  188  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  32.49 
 
 		 1598 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.49 
 
 		 698 aa  187  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>