More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0964 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 741 aa  1534    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  58.51 
 
 		 722 aa  892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  48.58 
 
 		 740 aa  747    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.14 
 
 		 738 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  34 
 
 		 740 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  32.93 
 
 		 736 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.6 
 
 		 744 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.98 
 
 		 725 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.83 
 
 		 740 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.43 
 
 		 743 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  36.45 
 
 		 723 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.44 
 
 		 711 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  33.29 
 
 		 734 aa  389  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.59 
 
 		 783 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  33.79 
 
 		 743 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.47 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.99 
 
 		 736 aa  364  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.79 
 
 		 755 aa  363  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  32.69 
 
 		 746 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  32.1 
 
 		 751 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.53 
 
 		 710 aa  350  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 		 739 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.59 
 
 		 708 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.13 
 
 		 716 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.61 
 
 		 696 aa  283  9e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.39 
 
 		 716 aa  260  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.94 
 
 		 701 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  33.59 
 
 		 694 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29 
 
 		 711 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 		 698 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.75 
 
 		 696 aa  240  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  32.21 
 
 		 710 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.98 
 
 		 706 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  31.01 
 
 		 925 aa  237  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.75 
 
 		 675 aa  237  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  30.68 
 
 		 925 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.27 
 
 		 711 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  31.21 
 
 		 702 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 		 694 aa  218  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  27.23 
 
 		 939 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 		 916 aa  194  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.73 
 
 		 916 aa  192  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  27.47 
 
 		 943 aa  188  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.97 
 
 		 970 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.82 
 
 		 972 aa  183  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  34.58 
 
 		 753 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.73 
 
 		 913 aa  180  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.84 
 
 		 931 aa  177  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  28.97 
 
 		 955 aa  177  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 905 aa  174  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  28.21 
 
 		 954 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.88 
 
 		 932 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.44 
 
 		 890 aa  171  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 928 aa  170  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 927 aa  168  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.54 
 
 		 946 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  27.05 
 
 		 946 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.18 
 
 		 933 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.72 
 
 		 912 aa  162  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.8 
 
 		 915 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 937 aa  162  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.32 
 
 		 928 aa  161  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  26.86 
 
 		 1480 aa  160  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1534 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.76 
 
 		 944 aa  157  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 926 aa  156  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  26.97 
 
 		 898 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  27.53 
 
 		 1573 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.91 
 
 		 915 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.97 
 
 		 1476 aa  154  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.13 
 
 		 897 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 909 aa  153  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.04 
 
 		 801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  26.29 
 
 		 1618 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  25.04 
 
 		 903 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  34.69 
 
 		 807 aa  147  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.74 
 
 		 806 aa  147  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  29.72 
 
 		 914 aa  147  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.49 
 
 		 872 aa  146  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  26.74 
 
 		 799 aa  146  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  29.11 
 
 		 807 aa  143  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.85 
 
 		 799 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.01 
 
 		 874 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.91 
 
 		 874 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.22 
 
 		 884 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.54 
 
 		 1508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.13 
 
 		 874 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 903 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.06 
 
 		 888 aa  140  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  27.77 
 
 		 834 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.74 
 
 		 799 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 1505 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  28.34 
 
 		 1572 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  29.19 
 
 		 1688 aa  139  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  26.41 
 
 		 1448 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  30.69 
 
 		 1379 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  26.77 
 
 		 875 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 1480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  26.81 
 
 		 1584 aa  139  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  29.22 
 
 		 868 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>